Stanovení nejčastějších původců sepse – Tereza Chámová

Anotace:

Stanovení nejčastějších původců sepse Pro svou absolventskou práci jsem si zvolila analýzu nejčastějších patogenů způsobujících sepsi. Motivací k výběru tohoto tématu byl rostoucí výskyt sepse a nutnost její rychlé diagnostiky a účinné léčby. Sepse je závažný a život ohrožující stav, který vyžaduje okamžitý lékařský zásah. Cílem této práce bylo určit nejčastější patogeny v krevních kulturách, porovnat údaje mezi dvěma nemocnicemi – Karlovy Vary a Cheb – a zhodnotit roli moderních diagnostických metod. Absolventská práce se skládá ze dvou hlavních částí – teoretické a praktické. Teoretická část přináší přehled o sepsi, její patofyziologii, rizikových faktorech a diagnostických metodách, a to jak klasických mikrobiologických postupech, tak i moderních technikách, jako je například MALDI-TOF Biotyper. Dále se věnuje i problematice antimikrobiální rezistence, která představuje rostoucí problém při léčbě sepse. Praktická část je založena na retrospektivní analýze laboratorních dat z obou nemocnic. Celkem bylo vyšetřeno 20 050 krevních kultur, z nichž 22,4 % bylo pozitivních. Mezi nejčastěji identifikované patogeny patřily Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae a Enterococcus faecalis. Zajímavým zjištěním byl vyšší výskyt Candida albicans v nemocnici Cheb, což může souviset s odlišnou skladbou pacientů nebo nemocničním prostředím. Výsledky byly porovnány s dalšími publikovanými studiemi a potvrdily globální trendy v etiologii sepse. Ve svém průzkumu jsem použila kvantitativní analýzu a srovnávací statistické metody pro posouzení rozložení patogenů. Zkoumala jsem také rozdíly mezi oběma nemocnicemi, jako je celkový počet odebraných hemokultur a podíl pozitivních nálezů. Průzkum ukázal, že v Karlových Varech byl vyšší celkový počet odebraných hemokultur, zatímco v Chebu byl zaznamenán vyšší podíl pozitivních výsledků. Průzkum úspěšně splnil své cíle, potvrdil převládající bakteriální patogeny a jejich rozložení v obou nemocnicích. Zjištění podporují nezbytnost rychlé mikrobiologické diagnostiky a průběžného sledování antimikrobiální rezistence. Budoucí průzkum by se mohl zaměřit na molekulární identifikaci rezistentních kmenů a zavádění rychlejších diagnostických postupů. …víceméně

Abstract:

Determination of the Most Common Pathogens of Sepsis For my graduate thesis, I chose to analyze the most common pathogens responsible for sepsis. My motivation for selecting this topic stems from the increasing incidence of sepsis and the necessity for it is rapid diagnosis and effective treatment. Sepsis is a severe and life-threatening condition that requires immediate medical intervention. The aim of this research was to determine the most frequently occurring pathogens in blood cultures, compare the data between two hospitals Karlovy Vary and Cheb, and evaluate the role of modern diagnostic methods. The study consists of two main parts. The theoretical and the practical. The theoretical section provides an overview of sepsis, it is pathophysiology, risk factors, and diagnostic methods, including classical microbiological approaches and modern techniques such as MALDI-TOF Biotyper. It also discusses antimicrobial resistance, which has become an increasing concern in the treatment of sepsis. The practical section is based on retrospective data analysis from laboratory records of both hospitals. A total of 20 050 blood cultures were examined, out of which 22,4 % were positive. The most common pathogens identified were Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, and Enterococcus faecalis. Interestingly, a higher incidence of Candida albicans was observed in the Cheb hospital, which may be attributed to a different patient population or hospital environment. The results were compared with other published studies, confirming global trends in the etiology of sepsis. In my research, I applied quantitative analysis and comparative statistical methods to assess the distribution of pathogens. I also examined differences between hospitals, such as the total number of collected blood cultures and the proportion of positive results. The study found that Karlovy Vary had a higher total number of blood cultures, while Cheb reported a higher percentage of positive results. The research successfully fulfilled its objectives, confirming the predominant bacterial pathogens and their distribution in both hospitals. The findings support the necessity of rapid microbiological diagnostics and the continua monitoring of antimicrobial resistance. Future studies should focus on the molecular identification of resistant strains and the implementation of faster diagnostic procedures. …víceméně