Hledání virů eustigmatofytních řas – Vladislava MAJNUŠOVÁ

Abstract:

Eustigmatofyti jsou třídou jednobuněčných řas, která byla až donedávna poněkud opomíjena. Jejich rostoucí význam, zejména v oblasti biotechnologie, však mezi vědci vzbudil zájem, nicméně, o parazitických elementech, které tyto řasy napadají, se stále mnoho neví. Cílem této práce je poskytnout vhled do světa oněch eukaryotických virů a přispět k pochopení koevoluce mezi viry a jejich hostiteli za využití laboratorních experimentů a bioinformatických metod. Podařilo se mi identifikovat a popsat desítky virům podobných entit v genomech eustigmatofytů, což dokazuje, že tyto mikrořasy představují rezervoár pro rozličné infekční agens. Mimo jiné byla objevena třída potencionálně nových sobeckých genetických elementů. Výsledky mých analýz také umožňují nahlédnout do extrémně spletité fylogeneze těchto elementů a rovněž podporují domněnku, že transpozibilní elementy zvané polinton-like viry dokážou tvořit viriony, tudíž jsou schopny "vyskočit" z genomu hostitele a vést tak dvojí způsob "života" zahrnující fázi transpozonu i fázi viru. …víceméně

Abstract:

Eustigmatophytes represent a class of unicellular algae that has been rather neglected until recently. Their growing potential, especially in the field of biotechnology, has aroused interest among researchers, but still, not much is known about the parasitic elements that invade them. The aim of the thesis is to provide an insight into the world of these eukaryotic viruses and to contribute to the understanding of the virus-host coevolution by the implementation of laboratory experiments and bioinformatic methods. I managed to identify and describe dozens of virus-like entities in the genomes of eustigmatophytes, proving that these microalgae represent a reservoir for various infectious agents. Besides that, a presumably new class of selfish genetic elements was discovered. The results of my analyses also offer a glimpse into the extremely tangled phylogeny of these elements and are congruent with the idea that transposable elements called polinton-like viruses are capable to form virions; and hence, possess the ability to "spring out" of the host genome, leading a dual "lifestyle" involving both a transposon and a viral phase. …víceméně