Lenka MIKULAJOVÁ

Bakalářská práce

Studium a chování tetranukleotidů v různých silových polích

Study of conformational behaviour of tetranucleotides using different force fields
Anotace:
Tato práce je zaměřena na studium chování r(GACC) tetranukleotidu, za pomoci molekulové dynamiky. Experimentální NMR data ukazují, že tento tetranukleotid zaujímá tzv. A-formu, avšak MD simulace za použití, v současné době nejpoužívanějšího silového pole 99bsc0OL3, vytváří interkalované struktury, které v experimentu nejsou pozorovány. Cílem této práce bylo zamezení vzniku interkalovaných struktur …více
Abstract:
This bachelor thesis is focused on behaviour of r(GACC) tetranucleotide using molecular dynamics. According the NMR data, this tetranucleotide adopts mostly A-form conformation. However, the MD simulations using popular 99bsc0OL3 force field populate non native intercalated structures. The aim of this bachelor thesis was to prevent formation of these intercalated structures using additional locally …více
 

Klíčová slova

Nukleové kyseliny RNA tetranukleotidy molekulární dynamika silové pole
 
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 2. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

  • Vedoucí: Mgr. Petra Kührová, Ph.D.

Citační záznam

Citovat tuto práci
Jak správně citovat práci

MIKULAJOVÁ, Lenka. Studium a chování tetranukleotidů v různých silových polích. Olomouc, 2018. bakalářská práce (Bc.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI, Přírodovědecká fakulta
https://stag.upol.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=225391 Odkaz na soubor do lokálního úložiště instituce

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Chemie / Aplikovaná chemie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Theses g482a0 g482a0/2
2. 5. 2018
Složky
Soubory
thesis Bakalsk_prce.pdf
MARKLOVÁ, E.
3. 5. 2018

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.