Programování v bioinformatice – Bc. Milan BUCHEL

Abstract:

Main goal of this thesis is familiarization about the theoretical basics of bioinformatics and also acquaintance with the best-known software tools for working in the field of bioinformatics. In the first chapter to get familiar with the basic concepts of bioinformatics. We answer the questions like what is bioinformatics, what kind of data formats it works with and where these data can be found. The second chapter is devoted to programming language, which is also the environment at the same time, in which we operate in the practical part of this paper. The third chapter presents specific software equipment needed for bioinformatics work. In the last part of this thesis, we will present some practical examples, which bioinformatics deals with. …víceméně

Abstract:

Hlavným cieľom tejto práce je oboznámenie sa s teoretickými základmi bioinformatiky a tiež ukážky najznámejších praktických softvérových nástrojov v bioinformatike na konkrétnych príkladoch. V prvej kapitole sa oboznámime so základnými pojmami bioinformatiky. Odpovieme si na otázky čo je to bioinformatika, s akými formátmi dát pracuje a kde sa tieto dáta nachádzajú. Druhá kapitola je venovaná programovaciemu jazyku, ktorý je zároveň aj prostredím v ktorom budeme pracovať v praktickej časti tejto práce. Tretia kapitola uvedie konkrétne softvérové vybavenie potrebné pre prácu bioinformatika. V poslednej časti tejto práce si ukážeme niekoľko praktických príkladov, ktorými sa bioinformatika zaoberá. …víceméně