Marlene GANZ

Bakalářská práce

Influence of Clustal W hyperparameters in multiple sequences alignment for AlignRUDDER

ClustalW, Multiple Sequence Alignment, Reinforcement learning, Influence of Clustal W hyperparameters in mutiple sequences alignment for AlignRUDDER
Abstract:
Reinforcement learning algorithms suffer from the delayed reward problem and usually only perform well when being trained with vast amounts of data. AlignRUDDER overcomes this problem by using a multiple sequence alignment for the initialization performed with ClustalW. In this thesis we work with different data­sets and AlignRUDDER to search for optimal align­ ment hyperparameters for reinforcement …více
Abstract:
Reinforcement learning algorithms suffer from the delayed reward problem and usually only perform well when being trained with vast amounts of data. AlignRUDDER overcomes this problem by using a multiple sequence alignment for the initialization performed with ClustalW. In this thesis we work with different data­sets and AlignRUDDER to search for optimal align­ ment hyperparameters for reinforcement …více
 

Keywords

ClustalW Reinforcement Learning AlignRUDDER Multiple Sequence Alignment Hyperparameter Search
 
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 17. 3. 2021

Obhajoba závěrečné práce

  • Vedoucí: prof. Dr. Sepp Hochreiter

Citační záznam

Citovat tuto práci
Jak správně citovat práci

GANZ, Marlene. Influence of Clustal W hyperparameters in multiple sequences alignment for AlignRUDDER. Č. Budějovice, 2021. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakulta
http://wstag.jcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=64542 Odkaz na soubor do lokálního úložiště instituce

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Applied Informatics / Bioinformatics

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Theses o65zkh o65zkh/2
17. 3. 2021
Složky
Soubory
thesis Bachelor_Thesis_MarleneGanz.pdf
Bulánová, L.
18. 3. 2021

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.