Bc. Petra ČECHOVÁ

Diplomová práce

Studium Na+/K+-ATPázy pomocí molekulárně-dynamických simulací

Molecular dynamics studies of Na+/K+-ATPase
Anotace:
Tato diplomová práce využívá metod výpočetní chemie ke zkoumání chování Na+/K+-ATPasy. Pomocí silového pole MARTINI je vytvořen model tohoto proteinu v membránách složených z různých lipidů (DSPC, DPPC, POPE), na kterém je následně pomocí molekulární dynamiky provedena simulace jeho chování po dobu 1 ?s. U takto získaných dat jsou pak sledovány konformační změny proteinu, pohyb iontů a rozložení lipidů …více
Abstract:
This thesis uses computational chemistry methods to study the behavior of Na+/K+-ATPase. Using MARTINI force field, we model the protein in membranes consisting of different lipids (DSPC, DPPC, POPE). The behavior of system on the timescale of 1 ?s is then simulated by using molecular dynamics. Obtained data are analysed with respect to conformational changes of the protein, ion movement and radial …více
 

Klíčová slova

N/K ATPasa DPPC DSPC POPE MARTINI molekulární dynamika
 
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 26. 4. 2013
Zveřejnit od: 26. 4. 2013

Obhajoba závěrečné práce

  • Vedoucí: Doc. RNDr. Martin Kubala, Ph.D.

Citační záznam

Citovat tuto práci
Jak správně citovat práci

ČECHOVÁ, Petra. Studium Na+/K+-ATPázy pomocí molekulárně-dynamických simulací. Olomouc, 2013. diplomová práce (Mgr.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta

Plný text práce

Právo: Autor si přeje zpřístupnit práci veřejnosti od 26.4.2013

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • Soubory jsou od 26. 4. 2013 dostupné: světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI, Přírodovědecká fakulta

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Fyzika / Molekulární biofyzika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
  • Žádné práce na příbuzné téma.
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Theses pj0wzo pj0wzo/2
29. 4. 2013
Složky
Soubory
thesis DPechov.pdf
MARKLOVÁ, E.
30. 4. 2013

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.