Sasiri Thisara NUGAPITIYA

Bakalářská práce

Exploration of contamination in Mesodinium species and its impact on phylogenomic analysis.

Exploration of contaminantions in Mesodenium species and its impact of phylogenomic analysis.
Abstract:
Mesodinium species has been a challenging species to position on phylogenomic tree due to its complex genomic structure and mixotrophic nutritional modes. This study aims to clarify this species true phylogenetic placement by categorizing genes with gene trees having contradictory positioning of Mesodinium sp. and then reconstructing phylogenetic trees with each group to observe if the position vary …více
Abstract:
Mesodinium species has been a challenging species to position on phylogenomic tree due to its complex genomic structure and mixotrophic nutritional modes. This study aims to clarify this species true phylogenetic placement by categorizing genes with gene trees having contradictory positioning of Mesodinium sp. and then reconstructing phylogenetic trees with each group to observe if the position vary …více
 

Keywords

Mesodinium species Phylogenetic Phylogenomic analysis Contaminations in genomics Mixotrophic nutritional modes Kleptoplasty Phylogenetic placement Deep branching taxa Ciliophora Gene tree reconstruction Long branch attraction Ciliate evolution Taxonomic sampling Systematic errors in phylogenetics Horizontal gene transfer Maximum likelihood Ultrafast bootstrap Genome-wide phylogenetics Species tree inference Mixotrophy
 
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 9. 12. 2024

Obhajoba závěrečné práce

  • Vedoucí: Mgr. Martin Kolísko, Ph.D.

Citační záznam

Citovat tuto práci
Jak správně citovat práci

NUGAPITIYA, Sasiri Thisara. Exploration of contamination in Mesodinium species and its impact on phylogenomic analysis.. České Budějovice, 2024. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakulta
http://wstag.jcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=77200 Odkaz na soubor do lokálního úložiště instituce

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biological Chemistry / Biological Chemistry

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
  • Žádné práce na příbuzné téma.
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Theses ut5mjw ut5mjw/2
9. 12. 2024
Složky
Soubory
thesis Nugapitiya_Thisara_2024_BT.pdf
Bulánová, L.
10. 12. 2024

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.