Cílená mutageneze C-koncové oblasti proteinu DEPDC5

Bc. Filip Kafka

Bachelor's thesis

Site-directed mutagenesis of the C-terminal region of DEPDC5 protein

Abstract:

Protein mTOR je serin/threoninová kináza, která hraje klíčovou roli při regulaci růstu a metabolismu buněk. Je centrální složkou dvou proteinových komplexů mTORC1 a mTORC2. Komplex mTORC1 přijímá mimo jiné signály o dostupnosti živin a signály zprostředkované růstovými faktory. Klíčovou součástí signální dráhy, která reguluje komplex mTORC1 v závislosti na přítomnosti dostatečného množství aminokyselin je proteinový komplex GATOR1, jehož součástí je protein DEPDC5. V této práci byly pomocí cílené mutageneze připraveny plazmidy pro expresi mutantních forem DEPDC5, jež byly nalezeny v nádorových buňkách. U těchto mutantů byla ověřena úroveň jejich exprese v savčích buňkách v porovnání s nemutovaným DEPDC5.

Abstract:

The mTOR protein is a serine/threonine kinase that functions as a critical regulator of cellular growth and metabolism. It nucleates two protein complexes – mTORC1 and mTORC2. The mTORC1 complex interprets, among others, signals about nutrient availability and growth factor signaling. A key part of the signaling pathway that regulates mTORC1 in response to amino acid levels is the GATOR1 protein complex, part of which is the DEPDC5 protein. In this thesis, we used site-directed mutagenesis to create DEPDC5 expression plasmids bearing cancer-associated mutations. The level of expression of mutant proteins was tested in comparison to a non-mutated DEPDC5 protein.

Keywords

mTOR, mTORC1, DEPDC5, GATOR1, cílená mutageneze

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 15. 5. 2019

Thesis defence

• Date of defence: 25. 6. 2019
• Supervisor: Mgr. Stjepan Uldrijan, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biochemistry / Biochemistry