Kapilární elektroforéza a její uplatnění v metabolomických studích

Mgr. Kateřina Foltová

Bachelor's thesis

Capillary electrophoresis and its application in methabolomic studies

Anotácia:

Metabolomika, nový směr analytické biochemie, může být považována za koncový bod „omics“ kaskády. Cílem metabolomiky je identifikovat a kvantifikovat všechny metabolity v biologickém vzorku a tedy i v celém organismu, a tím napomáhat porozumět fyziologickému stavu organismu. Metabolomika spolu s transkriptomikou, protetikou a genomikou představují celkový přístup k organismu. Metabolomická analýza zahrnuje odlišné strategie, jako jsou: metabolomika, metabolite target analysis, metabolite profilig, metabolic fingerprinting, metabolic footprinting a metabonomika.V této práci jsme použili CZE s UV detekcí pro stanovení optimálních podmínek pro separaci metabolitů získaných z bakterie Paracoccus denitrificans.

Abstract:

Metabolomics is the new science technology based on analytical biochemistry. This method could be possibly considered as the endpoint of the „omics“ cascade. The aim of metabolomics is to identify and quantify all the metabolites in biological samples and whole organisms in order understand the physiological state of an organism. Metabolomics in conjunction with transcriptomics, proteomics and genomics represent complex scientific admission for organisms.Metabolomics analysis includes various strategies such as metabolite target analysis, metabolic profilig, metabolic fingerprinting, metabolic footprinting and metabonomics.In this work, we used the CZE method with the UV detection in order to determine the optimal metabolite separation conditions for bacterium Paracoccus denitrificans.

Kľúčové slová

metabolomika, metabolismus, metabolit, metabolom, příprava vzorku, kapilární elektroforéza, kapilární zónová elektroforéza, pre-koncentrační techniky, field enhanced stacking, bakterie Paracoccus denitrificans, metabolomics, metabolite, metabolome, metabolite target analysis, metabolite profilig, metabolic fingerprinting, metabolic footprinting, metabolisms, sample preparation, metabolome analysis, capillary electrophoresis, capillary zone electrophoresis, preconcentration techniques

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2010
• Vedúci: prof. RNDr. Zdeněk Glatz, CSc.
• Oponent: Mgr. Marta Pelcová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry