Genetic Monitoring and Reproduction Management of Captive Ungulate Populations

Ing. Ing. Anna Kubátová

Doctoral thesis

Abstract:

Populační management je důležitým nástrojem chovů v lidské péči. Jeho metody se mohou lišit dle druhů a populačních charakteristik. V případě ohrožených druhů jejichž populace jsou malé je hlavním cílem zachování druhu pomocí zvýšení počtu jedinců a udržení adekvátního genofondu, aby byla zachována dostatečná variabilita a snížila se pravděpodobnost vyhynutí. U populací v lidské péči je dosažení tohoto cíle úzce spojeno s genetickým monitoringem a reprodukčním managementem, které jsou nezbytné pro dosažení zdravých a životaschopných populací v dlouhodobém horizontu. Tato dizertační práce je zaměřena na genetický monitoring kriticky ohroženého západního poddruhu antilopy Derbyho (Taurotragus derbianus derbianus) a reprodukční management u vybraných domestikovaných kopytníků žijících v oblasti tropů - alpaky (Vicugna pacos), velbloudi dvouhrbí (Camelus bactrianus), skot (Bos taurus) a osli (Equus asinus). Tyto druhy mohou být použity jako modelové organismy pro další příbuzné druhy, které podléhají lokálnímu či globálnímu ohrožení, např. antilopy a další bovidé, vikuně, divocí velbloudi dvouhrbí, divocí afričtí osli, zebry Grévyho nebo koně Převalského. Konkrétně byl zkoumán dopad různých způsobů managementu chovu na dvě populace antilop rodu Taurotragus skrze porovnání jejich populačních charakteristik, zároveň byla pomocí mikrosatelitů zkoumána možná mezidruhová hybridizace v rámci rodu Taurotragus a dále byly zkoumány neinvazivní metody diagnostiky březosti z moči (test chloridem barnatým, Cuboniho reakce, test klíčivosti semen) u alpak, velbloudů, jalovic a oslů. Výsledky této práce mohou být použity za účelem zlepšení managementu populací v záchranných programech zaměřených na zkoumané ohrožené taxony, nebo druhy příbuzné studovaným modelovým organismům. V neposlední řadě by nově zjištěné skutečnosti měly přispět chovu hospodářských zvířat pocházejících z oblasti tropů.

Abstract:

Population management is an important tool for captive breeding programs and its methods may differ according to the species and its population characteristics. In the case of endangered species suffering from small population sizes, the main goal is always conservation of the species over time. This means an increase in the number of individuals and maintenance of an adequate gene pool to preserve sufficient variability and reduce the probability of extinction. In captive and semi-captive populations, attainment of this goal is closely connected with the methods of genetic monitoring and reproduction management that are essential for achieving healthy and viable populations in a long-term period. This dissertation thesis has been directly focused on genetic monitoring in critically endangered Western Derby eland (Taurotragus derbianus derbianus) and reproduction management in various domestic ungulates living in tropics – alpacas (Vicugna pacos), Bactrian camels (Camelus bactrianus), cattle (Bos taurus) and donkeys (Equus asinus). They can be used as model organisms for their related species under local or overall threats, e.g. antelopes and other bovids, vicuñas, wild Bactrian camels, African wild asses, Grevy's zebras or Przewalski's horses. Specifically, the impact of different population managements applied in two semi-captive populations of Taurotragus spp. via the comparison of their population structure characteristics, detection of possible interspecific hybridization within the genus Taurotragus by microsatellite markers and non-invasive methods of pregnancy diagnosis from urine (barium chloride test, Cuboni reaction, seed germination test) in alpacas, Bactrian camels, heifers, and donkeys, has been explored. The results of this study could be used for proper population management in conservation programmes focused on examined endangered taxa or ungulates related to our model species. And last but not least, discovered facts should contribute to domestic animal husbandry of selected tropical species.

Keywords

Bos taurus, Camelus bactrianus, Equus asinus, Taurotragus spp., Vicugna pacos

Keywords

Camelus bactrianus, Equus asinus, Taurotragus spp., Bos taurus, Vicugna pacos

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 28. 7. 2020

Thesis defence

• Supervisor: Mgr. Barbora Černá Bolfíková, Ph.D.
• Reader: Luděk Stádník, Ph.D.

Czech University of Life Sciences Prague

Faculty of Tropical AgriSciences

Doctoral programme / field:
Agricultural Specialization / Tropical Agrobiology and Bioresource Management