Teoretické studium antiterminačního komplexu HutP – Bc. Pavlína Pokorná
Bc. Pavlína Pokorná
Bakalářská práce
Teoretické studium antiterminačního komplexu HutP
Theoretical Study of HutP Antitermination Complex
Anotace:
Tato bakalářská práce se věnuje popisu molekulových interakcí v pozitivně regulačním proteinu HutP z organismu B. subtilis v komplexu s RNA pomocí metod molekulové dynamiky. Práce se zaměřuje zvláště na rozhraní proteinu a RNA, jednotlivé protein-nukleotid vazebné interakce jsou vyhodnoceny na základě několika mikro-sekundových trajektorií. Celkově je sytém velmi stabilní, většina interakcí mezi proteinem …víceAbstract:
This bachelor thesis studies molecular interactions in the positive regulatory protein HutP from B. subtilis complexed with RNA using molecular dynamics methods. It is focused especially on the protein-RNA interface, the analysis of individual protein-nucleotide binding interactions is based on several micro-second trajectories. Generally, the system is very stable, the most of protein-RNA interactions …více
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 5. 2016
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/ozqv4/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 15. 6. 2016
- Vedoucí: prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasarykova univerzita
Přírodovědecká fakultaBakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Chemoinformatika a bioinformatika
Práce na příbuzné téma
-
Studium protein-RNA interakcí pomocí kryoelektronové mikroskopie
Nikola Nosková -
Molekulová dynamika dvou řetězců hyaluronanu ve směsných rozpouštědlech (virtuální experiment)
Alena Kolaříková -
Studium interakce kinásové C1 domény s fosfolipidovou membránou
Ľubomíra Valová -
Molekulová dynamika cyklin-dependentních protein kinas
Iveta Bártová -
Strukturní dynamika biomolekulárních komplexů
Pavlína Pokorná -
Interakce malých molekul s povrchy vdW materiálů
Dalibor TEIMER -
Použití Ramanovy optické aktivity ke studiu interakce rozpuštěné látky s rozpouštědlem
Pavel MICHAL -
Interakce malých hairpin formujících RNA molekul s povrchem grafenu
Martin VONDRÁK