Identifikace lyzujících bakteriofágů v přírodních populacích Ixodes ricinus

David HORÁK

Bachelor's thesis

Identification of lysing bacteriophages in natural populations of Ixodes ricinus

Abstract:

V rámci této práce jsem popsal základní problematiku bakteriofágů, jejich historii, současnost, využití a potenciál do budoucnosti. Dále jsem popsal bakterie Anaplasma phagocytophilum a Borrelia burgdorferi ve spojení s problematikou parasitismu Ixodes ricinus. Vymyslel jsem několik metodik jak na PCR mutagenezi, tak enzymatickou mutagenezi bakteriofágů, v rámci nichž popisuji modifikaci sekvencí odpovědných za kódování vazebných proteinů u fágů napadajících Escherichia coli, tak aby byly schopné kódovat vazebné proteiny na OspA u Borrelia burgdorferi. Tyto metodiky jsou analogicky použitelné i u dalších bakterií s výskytem v populaci Ixodes ricinus i mimo ni. Mimo již zmíněných metodik jsem srovnal fágovou terapii a léčbu antibiotiky. Dále jsem popsal problematiku vztahu imunitního systému pacientů a fágů použitých ve fágové terapii, problematiku laické veřejnosti. Na závěr jsem shrnul potenciální využití fágové terapie a zmínil možné směry, kterými by se výzkum bakteriofágů mohl v budoucnu ubírat.

Abstract:

In this work I described the basic issues of bacteriophages, their history, recent state, thein use and potential for the future. I also described the bacteria Anaplasma phagocytophilum and Borrelia burgdorferi in connection with the parasitism of Ixodes ricinus. I have invented several methodologies for both PCR mutagenesis and enzymatic mutagenesis of bacteriophages. In these methodologies I describe the modification of sequences responsible for coding binding proteins in phages attacking Escherichia coli, so as to be able to encode bindig proteins for OspA proteins which are specific for Borrelia burgdorferi. These methodologies are equally applicable to other bacteria found in and outside the Ixodes ricinus population. In addition to the aforementioned methodologies, I compared phage therapy and antibiotic treatment. Furthermore, I described the issue of the relationship between the immune system of patients and phages used in phage therapy and the issue of the laic public. In conclusion I described the potential use of phage therapy, and mentioned possible directions that bacteriophage research might take in the future.

Keywords

Bakteriofágy, fágová terapie, PCR mutageneze, konstrukce fágů, Borelia, Anaplasma

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 26. 4. 2019

Accessible from:: 31. 12. 2999

Thesis defence

• Supervisor: Mgr. Jaroslav Pavelka, Ph.D.

University of West Bohemia

Faculty of Education

Bachelor programme / field:
Natural Science Studies / Biology in Education