Strukturní studie lektinů z Photorhabdus luminescens

Bc. Filip Melicher

Diplomová práce

Structural studies of lectins from Photorhabdus luminescens

Abstract:

The diploma thesis is focused on structural characterization of lectins PLU34, PLU35 and PLU36 from gram-negative bacterium Photorhabdus luminescens. Protein crystallography method was used to obtain the structure of these proteins. After the crystallization conditions were found, the best hits were further optimized to obtain high resolution diffraction data. The result of the experiments was the structure of complex of PLU34 with D-galactose at 1.05 Å resolution and the structure of PLU35 at 1.3 Å resolution. Obtained structural information may be used to reveal the function of these proteins and explain their role in the life cycle of the P. luminescens.

Abstract:

Diplomová práce se zabývá strukturní charakterizací lektinů PLU34, PLU35 a PLU36 z gramnegativní bakterie Photorhabdus luminescens. K zisku struktury proteinů byla použita proteinová krystalografie. Po nalezení krystalizačních podmínek byly nejlepší z nich optimalizované k získání difrakčních dat s vysokým rozlišením. Výsledkem experimentů byl zisk struktury komplexu PLU34 s navázanou D-galaktózou v rozlišení 1,05 Å a struktury lektinu PLU35 v rozlišení 1,3 Å. Získané strukturní informace mohou sloužit k objasnění funkce těchto proteinů a vysvětlit jejich roli v životním cyklu bakterie P. luminescens.

Klíčová slova

Photorhabdus, luminescens, lektín, strukturní, proteínová krystalografie, štruktúrne, proteínová kryštalografia, lectin, structural, protein crystallography

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 22. 6. 2018
• Vedoucí: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
• Oponent: Ing. Tibor Füzik, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Biomolekulární chemie