Genetická analýza přeživších jedinců smrku ztepilého po kůrovcovém ataku

Bc. Jan Procházka

Diplomová práce

Genetic analysis of Norway Spruce individuals survived bark beetle attack

Anotace:

Předložená závěrečná práce s genetickým zaměřením na smrk ztepilý sleduje dvě Šumavské populace z hlediska odolnosti. Cílem bylo pomocí vybraných mikrosatelitových lokusů analyzovat genetickou strukturu jedinců přeživších v oblastech intenzivního kůrovcového ataku (tzv. last standing trees) a porovnat ji s referenční populací tvořenou jedinci, kteří nebyli vystaveni tlaku kůrovce. Byla posuzována míra genetické diferenciace mezi těmito populacemi. Pomocí SSRs markerů a multiplex PCR bylo možné analyzovat celkem 96 vzorků, z toho 48 pro každou populaci. Rešeršní část popisuje ekologii smrku, škodlivé vlivy a základní přehled o genetice druhu. Vyhodnocení dat probíhalo v programech GenAIEx a adegenet jako doplněk do softwaru R. Výsledky obsahují data o polymorfismu, F-statistice a celkové variabilitě obou populací. V závěru práce jsou výsledky diskutovány a popsána doporučení pro budoucí výzkumy.

Abstract:

The presented final work with a Genetic focus on Norway spruce monitors two Sumava populations in terms of resistance. The aim was to use selected microsatellite loci to analyze the genetic structure of survivors in areas of intense bark beetle attack (so-called last standing trees) and compare it with a reference population of individuals who were not exposed to bark beetle pressure. The degree of genetic differentiation between these populations was assessed. Using SSRs markers and multiplex PCR, a total of 96 samples could be analyzed, of which 48 for each population. The research part describes the ecology of spruce, harmful influences and a basic overview of the genetics of the species. Data evaluation took place in GenAIEx and adegenet programs as a supplement to the R software. The results include data on polymorphism, F-statistics and overall variability of both populations. At the end of the work, the results are discussed and recommendations for future genetic studies.

Klíčová slova

kůrovec, last standing trees, mikrosatelitové markery

Keywords

bark beetle, microsatellite markers, last standing trees

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 20. 4. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Ing. Jiří Korecký, Ph.D.

Česká zemědělská univerzita v Praze

Fakulta lesnická a dřevařská

Magisterský studijní program / obor:
Lesní inženýrství / Lesní inženýrství