Vykreslování molekulárních dat ve vysoké kvalitě

Bc. Dušan Lipták

Diplomová práce

High quality visualization of molecular data

Abstract:

Rendering molecular data plays an important role in current research in the field of chemistry. Visual analysis means one of the basic methods of work with molecular models. The thesis provides current state of molecular data visualization and the need to render them in high quality. It also describes most frequently used rendering techniques and technologies which support them. Next it focuses on its primary goal – extending CAVER Analyst application by the function which enables rendering in high quality. This extension uses the existing renderer OSPRay and it was designed and implemented as a new application module. Benefits of the new function of CAVER Analyst application are assessed from the point of view of time necessary for rendering and quality of the final image. It will be mainly appreciated by users of CAVER Analyst application who require creating quality illustrations to publish in scientific magazines.

Abstract:

Vykresľovanie molekulárnych dát hrá v súčasnom chemickom výskume dôležitú úlohu. Vizuálna analýza totiž predstavuje jeden zo základných spôsobov práce s molekulárnymi modelmi. Diplomová práca zachytáva súčasný stav vizualizácie molekulárnych dát a potrebu ich vykresľovania vo vysokej kvalite. Popisuje tiež najpoužívanejšie techniky vykresľovania a technológie, ktoré ich podporujú. Ďalej sa sústredí na svoj primárny cieľ – rozšírenie aplikácie CAVER Analyst o funkcie umožňujúce vykresľovanie vo vysokej kvalite. Toto rozšírenie využíva existujúci renderer OSPRay a bolo navrhnuté a implementované ako nový aplikačný modul. Prínosy novej funkcionality pre aplikáciu CAVER Analyst sú vyhodnotené z hľadiska času potrebného pre vykresľovanie a kvality výsledného obrazu. Ocenia ju najmä užívatelia aplikácie CAVER Analyst, ktorí požadujú vytváranie kvalitných ilustrácií pre účely publikácie vo vedeckých časopisoch.

Klíčová slova

molekulárne dáta, vykresľovanie, ray tracing, OSPRay, CAVER Analyst, Java, C++, JNI, SWIG

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 12. 12. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 5. 2. 2019
• Vedoucí: RNDr. Adam Jurčík, Ph.D.
• Oponent: RNDr. Filip Škola

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

Magisterský studijní program / obor:
Informatika / Počítačová grafika