Výskyt virových chorob v porostech cukrové řepy a tykvovité zeleniny

Bc. David Kraus

Master's thesis

Occurrence of virus diseases in sugar beet and cucurbitaceous vegetable

Abstract:

Choroby rostlin způsobené virovými patogeny působí každoročně významné ztráty na výnosu a kvalitě zemědělské produkce po celém světě. Tato diplomová práce poskytuje základní informace o výskytů virových patogenů na cukrové řepě a tykvovité zelenině v polních podmínkách České republiky. Detekce patogenů byla provedena pomocí třech diagnostických metod, a to konkrétně s využitím sérologických metod DAS-ELISA (double antibody sandwich – enzyme-linked immuno-sorbent assay), TAS-ELISA (triple antibody sandwich – enzyme-linked immuno-sorbent assay) a molekulární metody RT-PCR (reverzní transkripce – polymerázová řetězová reakce). V první části zaměřené na virové choroby cukrové řepy se konkrétně jednalo o virus žloutenky řepy (beet yellows virus, BYV), virus mírného žloutnutí řepy (beet mild yellowing virus, BMYV) a virus chlorózy řepy (beet chlorosis virus, BChV). Pro tyto účely bylo vybráno několik lokalit z oblasti Středočeského, Kralovehradeckého, Pardubického, Olomouckého a Moravskoslezkého kraje. U námi testovaných vzorků bylo přítomno 31,34 % zástupců z rodu Polerovirus a 19,4 % rostlin pozityvních na BYV. U části testovaných vzorků byla dále pomocí metody RT-PCR potvrzena přítomnost BChV, naopak přítomnost BMYV nebyla zaznamenána. Dále byla tato diplomová práce zaměřena na výskyt virových patogenů u tykvovité zeleniny. Jednalo se konkrétně o virus žluté mozaiky cukety (zucchini yellow mosaic virus, ZYMV), virus mozaiky okurky (cucumber mosaic virus, CMV), virus mozaiky tykve (squash mosaic virus, SqMV), virus mozaiky vodního melounu (watermelon mosaic virus, WMV) a virus žloutnutí okurky přenášený mšicemi (cucurbit aphid-borne yellow virus, CABYV). U námi testovaných vzorků byli přítomni pouze zástupci ZYMV a to u 88.81 % testovaných rostlin, WMV u 87,50 % a CMV pouze u 3,95 % testovaných rostlin.

Abstract:

Plant diseases caused by viral pathogens cause significant losses in the yield and quality of agricultural production worldwide every year. This diploma thesis provides basic information about the incidence of viral pathogens on sugar beet and cucurbit vegetables in the field conditions of the Czech Republic. Pathogens were detected using three diagnostic methods, specifically using the serological methods DAS-ELISA (double antibody sandwich – enzyme-linked immuno-sorbent assay), TAS-ELISA (triple antibody sandwich – enzyme-linked immuno-sorbent assay) and molecular method RT-PCR (reverse transcription – polymerase chain reaction). In the first part of the thesis focused on virus diseases of sugar beet, it was specifically the beet yellows virus (BYV), the beet mild yellowing virus (BMYV) and the beet chlorosis virus (BChV). Several locations from the, Central Bohemian region, Hradec Kralove region, Pardubice region, Olomouc region and Moravian-Silesian region were selected for the purpose. In the samples we tested, were presence of the genus Polerovirus in 31.34 % and BYV in 19.4 % of the tested plants. In part of the tested samples, the presence of BChV was further confirmed using the RT-PCR method, on the contrary, the presence of BMYV was not confirmed. Furthermore, this thesis focused on the incidence of viral pathogens in cucurbit vegetables. These were specifically zucchini yellow mosaic virus (ZYMV), cucumber mosaic virus (CMV), squash mosaic virus (SqMV), watermelon mosaic virus (WMV) and cucurbit aphid-borne yellow virus (CABYV). In the samples we tested, were only representatives of ZYMV who was present in 88.81 % of the tested plants, WMV in 87.50 % and CMV in only 3.95 % of the tested plants.

Keywords

ELISA (Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay), RT-PCR (Reverse Transcription – Polymerase chain reaction), rostlinné viry, cukrová řepa, tykvovitá zelenina

Keywords

ELISA (Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay), RT-PCR (Reverse Transcription – Polymerase chain reaction), plant viruses, sugar beet, cucurbit vegetables

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 25. 4. 2023

Thesis defence

• Date of defence: 16. 5. 2023
• Supervisor: prof. Ing. Pavel Ryšánek, CSc.
• Reader: Jaroslav Salava, externi

Czech University of Life Sciences Prague

Faculty of Agrobiology, Food and Natural Resources

Master programme:
Phytosanitary