Volná cirkulující DNA dárce jako marker pro sledování časné rejekce alogenního štěpu

Bc. Karolína Kožená

Bachelor's thesis

Donor-derived cell-free DNA as a marker monitoring early allograft rejection

Anotácia:

Rejekce je jedním z hlavních z důvodů selhání transplantační léčby, a proto je nezbytné monitorovat stav štěpu. Kvůli neexistenci dostatečně citlivých a specifických markerů zůstává jedinou spolehlivou metodou detekce rejekcí biopsie. Tato invazivní metoda však obnáší riziko mnoha komplikací. Jedním z nově navrhovaných markerů rejekcí je volná cirkulující DNA dárce (dd-cfDNA). Rozdíly v genomech dárce a příjemce umožňují odlišení dárcovské frakce cfDNA v krvi příjemce a tím i její kvantifikaci pomocí metod kvantitativní PCR, digitální PCR nebo sekvenování nové generace. Principem diagnostiky rejekcí je sledování hladiny dd-cfDNA, jejíž zvýšení značí poškození buněk štěpu. Tato práce shrnuje dosavadní poznatky o možnostech stanovení dd-cfDNA a hodnotí její potenciál coby markeru akutní rejekce štěpu.

Abstract:

Rejection is one of the major causes of transplantation failure, therefore it is necessary to monitor graft health. Since no markers are sensitive and specific enough, the biopsy remains the only reliable method to detect rejection. However, this method carries a great risk of complications. One of the proposed markers of rejection is donor-derived cell-free DNA (dd-cfDNA). Differences between donor and recipient genome enable to distinguish fraction od dd-cfDNA in the recipient blood and thus quantify it using quantitative PCR, digital PCR or next-generation sequencing. The principle of diagnostics of rejection is surveillance of dd-cfDNA level, elevation of which is associated with graft-cells damage. This thesis presents a summary of existing findings about the determination of dd-cfDNA and assesses its potential as a marker of acute graft rejection.

Kľúčové slová

volná cirkulující DNA, transplantace, akutní rejekce, neinvazivní diagnostika, cell-free DNA, transplantation, acute rejection, non-invasive diagnostics

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 6. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 3. 7. 2020
• Vedúci: Mgr. Hana Grombiříková
• Oponent: RNDr. Jitka Kadlecová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Medical Genetics and Molecular Diagnostics / Medical Genetics and Molecular Diagnostics