Vazba proteinu p53 s DNA neobsahující p53CON sekvence v lineární a superhelikální DNA.

Monika KOPEČKOVÁ

Bachelor's thesis

Interactions of p53 protein with linear and supercoiled DNA not containing p53CON.

Abstract:

Nádorový supresor p53 je důležitý transkripční faktor, který při působení stresových faktorů na buňku umožňuje zastavení buněčného cyklu, opravu DNA nebo zahájení procesu apoptózy, čímž zabraňuje vážnému poškození DNA a vzniku nádorových buněk. Pro účinnou regulaci buněčných procesů je nutná vazba proteinu p53 na DNA. V této práci byla zkoumána sekvence DNA, u které by se mohly nacházet vhodné struktury pro vazbu proteinu p53. K určení těchto struktur byla použita enzymatická sonda nukleáza S1 a restrikční endonukleázy. Také byla testována vazba proteinu p53 ke zkoumané sekvenci.

Abstract:

The tumor suppressor p53 is an important transcription factor, when is exposed to stress factors on the cell it will allow to stop the cell cycle, DNA repair, or initiate the process of apoptosis. Thereby preventing serious damage to the DNA of the tumor cells. The effective regulation of cellular processes is necessary for the binding of p53 to DNA. In this study the DNA sequence which could have a structure to bind with p53 will be examined. Enzymatic probe S1 nuclease and restriction endonucleases was used for the identification of these structures. They were also tested for binding of p53.

Keywords

protein p53, sekvenčně specifická vazba, sekvenčně nespecifická vazba, lokální otevřené struktury DNA, restrikční endonukleázy

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 22. 4. 2013

Accessible from:: 22. 4. 2013

Thesis defence

• Date of defence: 21. 5. 2013
• Supervisor: RNDr. Petr Pečinka, Ph.D.

University of Ostrava

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biology / Experimental Biology