Genetická diverzita a populačně genetická struktura evropských populací Plasmopara halstedii

Bc. Hana KRIŽŇANSKÁ

Bachelor's thesis

Genetic diverzity and population genetic structure of European populations of Plasmopara halstedii

Anotácia:

V této bakalářské práci jsem se zaměřila na polymorfní markery Plasmopara halstedii, původce plísně slunečnice, a jejich využití pro genetickou analýzu variability evropských populací. Teoretická část je zaměřena na charakteristiku třídy Oomycetes, čeledi Peronosporaceae, biologie, životního cyklu a hostitelského okruhu Plasmopara halstedii. Druhá polovina teoretické části je věnována mikrosatelitům, jejich klasifikaci a použití v populačně genetických studiích. V rámci experimentální části byla provedena analýza 162 vzorků Plasmopara halstedii pomocí 40 mikrosatelitních markerů. Ze 40 markerů bylo označeno jako polymorfní 11 mikrosatelitních markerů. Tyto markery byly následně využity k populačně genetickým analýzám pěti metapopulací z České republiky, Německa, Francie, Ruska a Maďarska, a srovnávány se vzorky z dalších oblastí.

Abstract:

In this bachelor thesis I focus on polymorphic markers of Plasmopara halstedii, the cause of sunflower downy mildew, and their usage for genetic analysis of variability of its European populations. The theoretical part characterises class Oomycetes, family Peronosporaceae, with focus on biology, life cycle and host range of Plasmopara halstedii. The second half of theoretical part is dedicated to microsatellites, their classification and usage in population genetic studies. Within the experimental part of this thesis, 162 samples of Plasmopara halstedii were analyzed using 40 microsatellite markers. Out of the 40 markers, 11 microsatellite markers were identified as polymorphic. These markers were then used for genetic analysis of 5 metapopulation from the Czech Republic, Germany, France, Russia and Hungary, and were compared with samples from other areas.

Kľúčové slová

genetická variabilita, mikrosatelity, obligátně biotrofní parazité rostlin, Plasmopara halstedii

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 24. 7. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 24. 8. 2020
• Vedúci: RNDr. Miloslav Kitner, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biology / Molecular and Cell Biology