Využití cirkulujících mikroRNA pro neinvazivní časnou diagnostiku kolorektálního karcinomu

Mgr. Michaela Vyhňáková

Master's thesis

Usage of circulating microRNAs for non-invasive early diagnosis in colorectal cancer

Anotácia:

Cílem této diplomové práce bylo nalézt vhodné cirkulující mikroRNA, které by mohly sloužit jako nové biomarkery pro časnou diagnostiku kolorektálního karcinomu. Jako kandidátní mikroRNA byla vybrána miR-21, jejíž míra exprese byla dále testována metodou kvantitativní polymerázové reakce v reálném čase. Pro účely optimalizace post-analytické fáze byly také testovány různé mikroRNA a jedna snRNA jako endogenní kontroly. Často využívaná endogenní kontrola miR-16 se v této diplomové práci nepotvrdila jako vhodná, naopak na základě výsledků lze pro normalizaci dat doporučit kombinaci miR-106a a let-7a. Onkogenní miR-21 byla exprimována ve všech vzorcích krevního séra, jak pacientů, tak zdravých kontrol, a míra její exprese narůstala se zvyšujícím se klinickým stádiem onemocnění. Výsledky této práce naznačují, že miR-21 by mohla být v budoucnu využita nejen jako nový diagnostický biomarker, ale též jako nový nástroj pro určování prognózy pacientů s kolorektálním karcinomem.

Abstract:

In this thesis the determination of suitable circulating microRNA as a diagnostic biomarker for colorectal cancer is studied. Mir-21 was selected as a candidate microRNA and its gene expression was analysed by reverse transcription quantitative polymerase chain reaction. To establish specific microRNA molecules as eligible endogenous controls for data normalization, eight different microRNAs and also one snRNA were tested. MiR-16 is often used as a reference gene, but on the results of this thesis miR-16 turn out not to be a suitable endogenous control; on the contrary the combination of miR-106a and let-7a is recommended. Oncogenic miR-21 was expressed in all samples of blood serum samples in both colorectal cancer pacients and the healthy controls and its expression level increased with the clinical stage of this disease. The results of this study indicate that miR-21 could serve not only as a new diagnostic biomarker, but also as a promising tool for determination of prognosis of patients with colorectal cancer.

Kľúčové slová

kolorektální karcinom, mikroRNA, diagnostické biomarkery, endogenní kontrola, hemolýza, colorectal cancer, microRNA, diagnostic biomarkers, endogenous control, haemolysis

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 1. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 5. 2. 2015
• Vedúci: doc. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry