Donory oxidu dusnatého pro studium bakteriálního metabolismu

Bc. Tereza Němcová

Diplomová práce

Nitric oxide donors for studying bacterial metabolism

Anotace:

Oxid dusnatý (NO) je regulační a cytotoxická molekula, která se účastní řady fyziologických a patofyziologických pochodů v živých organismech. U eukaryot vzniká oxidací L-argininu účinkem NO synthas. U denitrifikačních bakterií je NO meziproduktem denitrifikační dráhy, v níž se dusičnan redukuje čtyřmi následnými enzymovými reakcemi až na molekulový dusík. V přítomnosti kyslíku se oxid dusnatý rychle oxiduje na oxid dusičitý (NO2), a ztrácí tak biologickou účinnost. Pro definované dávkování proto mají význam látky kontinuálně uvolňující NO při svém samovolném rozkladu. V této práci byla provedena studie inhibičního působení NO (s využitím volného NO nebo generovaného z donoru) na terminální oxidasy Paracoccus denitrificans. Dále byla provedena studie regulačního působení NO na úrovni proteomu u divokého kmene Paracoccus denitrificans a kmene bez transkripčního faktoru NNR, který slouží jako senzor pro NO.

Abstract:

Nitric oxide (NO) is the cytotoxic and regulatory molecule involved in many physiological and pathophysiological processes in living organisms. In eukaryotes, nitric oxide synthases catalyze the oxidation of L-argininu to NO and citruline. In denitrifying bacteria, NO is the intermediate in the denitrification pathway, where the nitrate is reduced by four successive enzymatic reactions to the molecular nitrogen. In the presence of oxygen, NO is rapidly oxidized to nitrogen dioxide (NO2) and loses the biological activity. Continuously NO-releasing substances during their spontaneous decay are relevant to the defined dosing In this work, the study of the inhibitory effect of NO (free NO or generated from NO donor) on terminal oxidases of Paracoccus denitrificans was performed. Further, the study of the regulatory action of NO at the level of the proteome was performed in the wild strain of Paracoccus denitrificans and the strain without the transcription factor NNR, which serves as a sensor for NO.

Klíčová slova

Oxid dusnatý, NONOát, Paracoccus denitrificans, terminální oxidasy, exprese, regulace, nitric oxide, NONOate, terminal oxidases, expression, regulation

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 7. 6. 2010
• Vedoucí: prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biochemie / Analytická biochemie