Parametrizace metody EEM pro výpočet nábojů v proteinech – Mgr. Alžběta Türková
Mgr. Alžběta Türková
Bachelor's thesis
Parametrizace metody EEM pro výpočet nábojů v proteinech
Parametrization of EEM Approach for Calculation of Charges in Proteins
Abstract:
Parciální atomové náboje jsou reálná čísla, která popisují rozložení elektronové hustoty na atomech v rámci molekuly. Nelze je přímo určit pomocí experimentálních metod, neboť atomové náboje nejsou fyzikálně pozorovatelné veličiny. Jsme tedy odkázáni na jejich výpočet pomocí metod teoretické chemie. Tyto metody se formálně dělí do dvou skupin. Kvantově mechanické ab-initio metody poskytují přesné výsledky …moreAbstract:
Partial atomic charges are real numbers that describe distribution of electronic density in the atoms within a molecule. They cannot be directly measured via experimental methods, because atomic charges are not physically observable quantities. Therefore, we have to rely on their calculation using methods of theoretical chemistry. These methods are formally divided into two branches. Quantum mechanical …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 18. 5. 2015
Identifier:
https://is.muni.cz/th/mjveq/
Thesis defence
- Date of defence: 19. 6. 2015
- Supervisor: RNDr. Stanislav Geidl
- Reader: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceBachelor programme / field:
Biochemistry / Chemoinformatics and Bioinformatics
Theses on a related topic
-
Parciální atomové náboje peptidů
Ondřej Schindler -
Parciální atomové náboje na proteinech
Ondřej Schindler -
Atomové typy v metodách pro výpočet parciálních atomových nábojů
Radka Sedláková -
Srovnání machine-learningových přístupů pro výpočet parciálních atomových nábojů
Jan Bříza -
Backend pro databázi parciálních atomových nábojů
Miroslava Voglová -
Frontend pro databázi parciálních atomových nábojů
Dominik Toušek -
Empirické metody pro výpočet parciálních atomových nábojů
Ondřej Schindler -
Modern visualization of partial atomic charges in Mol*
Dominik Tichý