Parametrizace metody EEM pro výpočet nábojů v proteinech – Mgr. Alžběta Türková
Mgr. Alžběta Türková
Bachelor's thesis
Parametrizace metody EEM pro výpočet nábojů v proteinech
Parametrization of EEM Approach for Calculation of Charges in Proteins
Anotácia:
Parciální atomové náboje jsou reálná čísla, která popisují rozložení elektronové hustoty na atomech v rámci molekuly. Nelze je přímo určit pomocí experimentálních metod, neboť atomové náboje nejsou fyzikálně pozorovatelné veličiny. Jsme tedy odkázáni na jejich výpočet pomocí metod teoretické chemie. Tyto metody se formálně dělí do dvou skupin. Kvantově mechanické ab-initio metody poskytují přesné výsledky …viacAbstract:
Partial atomic charges are real numbers that describe distribution of electronic density in the atoms within a molecule. They cannot be directly measured via experimental methods, because atomic charges are not physically observable quantities. Therefore, we have to rely on their calculation using methods of theoretical chemistry. These methods are formally divided into two branches. Quantum mechanical …viac
Jazyk práce: English
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 18. 5. 2015
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/mjveq/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 19. 6. 2015
- Vedúci: RNDr. Stanislav Geidl
- Oponent: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceBachelor programme / odbor:
Biochemistry / Chemoinformatics and Bioinformatics
Práce na příbuzné téma
-
Parciální atomové náboje peptidů
Ondřej Schindler -
Parciální atomové náboje na proteinech
Ondřej Schindler -
Atomové typy v metodách pro výpočet parciálních atomových nábojů
Radka Sedláková -
Srovnání machine-learningových přístupů pro výpočet parciálních atomových nábojů
Jan Bříza -
Backend pro databázi parciálních atomových nábojů
Miroslava Voglová -
Frontend pro databázi parciálních atomových nábojů
Dominik Toušek -
Empirické metody pro výpočet parciálních atomových nábojů
Ondřej Schindler -
Empirical methods for calculating partial atomic charges
Tomáš Raček