Nové metody detekce poškození buněčné DNA

Bc. Jiří Smutný

Diplomová práce

New methods of cellular DNA damage detection

Anotace:

Srovnání citlivosti testů genotoxicity GreenScreen Assay a SOS chromotestu. GreenScreen se provádí na modifikované kvasince Saccharomyces cerevisiae. Ta využívá pro měření genotoxicity fúzní gen RAD54-GFP. SOS chromotest je zaužívaný test genotoxicity a provádí se na E. coli. Měření genotoxicity probíhá měřením aktivity betagalaktosidázy a alkalické fosfatázy. Srovnání citlivosti těchto testů proběhlo na matrici organických extraktů vzduchu. Srovnání proběhlo na extraktech z 6 frakcí částic vzduchu v rozsahu od 10 - 0 mikrometrů. Dále se využil extrakt z odběru plynné frakce. Hodnotila se i míra genotoxického potenciálu jednotlivých frakcí a jejich srovnání s množstvím prachových částic v dané frakci a obsahem PAH. Zkoumalo se 6 lokalit na jižní Moravě. Největší genotoxický potenciál měly extrakty ze vzorku odebraného na ulici Kotlářská

Abstract:

Comparison of two genotoxicity assays - GreenScreen assay and SOS chromotest. GreenScreen is done with genetically modified yeast Saccharomyces cerevisiae. It uses for measuring of genotoxicity fused gene RAD54-GFP. SOS chromotest is common assay in our laboratory for measuring genotoxicity of environmental samples. It is done with Escherichia coli. To identify genotoxic potential the activity of betagalactosidase and alkaline phosphatase is used. Comparing of sensitivity of these assays was made on organic extracts from air and particle matter. There were studied extract from 6 different fractions from 0 to 10 micrometers and from PUF. In each fraction there was compare the value of genotoxic potential with amount of particle matter and contents of PAHs. Studied samples were from six different localities in south Moravia. Samples from locality Kotlarska street in Brno were the most genotoxic in both assays.

Klíčová slova

GSA, GreenSreen assay, SOS chromotest, PM, PM10, PM2, 5, PUF, air pollution, znečištění vzduchu, genotoxicita, genotoxicity, PAHs, polycyklické aromatické uhlovodíky, karcinogenita, carcinogenity

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 19. 5. 2009

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 16. 6. 2009
• Vedoucí: doc. RNDr. Pavel Čupr, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Molekulární biologie a genetika