RealTime PCR detekce a DNA sekvenace rodu Borrelia ze vzorků klíšťat získaných z různých oblastí České republiky

Mgr. Václav Klíč

Bachelor's thesis

RealTime PCR detection and DNA sequencing of genus Borrelia from samples of ticks obtained from different parts of the Czech Republic

Anotácia:

Lymeská borelióza je geograficky značně rozšířené onemocnění, jehož původce – bakteriální komplex Borrelia burgdorferi sensu lato (Bbsl) byl objeven a popsán teprve nedávno. Tento bakteriální rod je přenášen především klíšťaty rodu Ixodes. Lymeská borelióza je multiorgánové onemocnění, které má celou řadu příznaků. V České republice se každým rokem touto nemocí nakazí 3-5 tisíc lidí a je to tedy častější onemocnění než klíšťová encefalitida. V současnosti spadá do komplexu Borrelia burgdorferi sensu lato 19 druhů lišících se ve svém genomu a ve schopnosti vyvolat Lymeskou boreliózu. Dále se pak liší svým geografickým zastoupením. Cílem této práce bylo určit druhové zastoupení Bbsl na území České republiky s důrazem na Jihomoravský kraj s využitím metod RealTime PCR a DNA sekvenace.

Abstract:

Lyme borreliosis is a geographically widespread disease caused bacterial complex Borrelia burgdorferi sensu lato, which has been discovered and described short time ago. This bacterial complex is mainly transmitted by the ticks of the genus Ixodes. Lyme disease is a multi-organ disease, which has a wide range of symptoms. This disease infects anually 3 to 5 thousand people in the Czech Republic and it is more frequent than the tick-borne encephalitis. Recently, the complex Borrelia burgdorferi sensu lato contains 19 genospecies, that are different in their genome and in the ability to cause Lyme disease. They also differ in their geographic representation. The aim of this study was to determine the Borrelia burgdorferi species representation in the Czech Republic with an emphasis on Southern Moravian County. Main methods which were used were RealTime PCR and DNA sequencing.

Kľúčové slová

Lymeská borelióza, Borrelia burgdorferi sensu lato, RealTime PCR, DNA sekvenace

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 5. 2014

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 16. 6. 2014
• Vedúci: prof. RNDr. Omar Šerý, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry