Zpět na vyhledávání

Bc. Dávid Šutor

Bachelor's thesis

GPU acceleration of the continuous heterogeneity analysis in Xmipp

GPU acceleration of the continuous heterogeneity analysis in Xmipp
Abstract:
Cieľom tejto práce je zrýchliť implementáciu novej metódy pre kontinuálnu analýzu heterogenity na CPU. Kód bol analyzovaný s cieľom identifikovať úzke miesta, ktoré boli následne riešené prepísaním príslušných častí pomocou CUDA pre akceleráciu na GPU. Implementácia na GPU výrazne zlepšila výkon s 62-násobným zrýchlením oproti paralelnej implementácii na CPU. Tento výsledok potvrdzuje možnosť využitia …more
Abstract:
This thesis aims to accelerate the CPU implementation of a new method for continuous heterogeneity analysis. The code was analyzed to identify bottlenecks, which were then addressed by rewriting the appropriate sections using CUDA for GPU acceleration. The GPU implementation demonstrated a significant performance improvement, with a speedup of 62 times compared to the parallel CPU implementation. This …more
 

Keywords

CUDA Xmipp GPU acceleration Cryo-EM ZART
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 18. 5. 2023
Identifier: https://is.muni.cz/th/ws71w/

Thesis defence

  • Date of defence: 27. 6. 2023
  • Supervisor: RNDr. Jiří Filipovič, Ph.D.
  • Reader: Ing. Jana Hozzová, Ph.D.

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky
Složka Reference to the local database directory of the institution