Problematika kultivačního vyšetření stolice - bakteriologie

Lukáš KAVALEC

Bachelor's thesis

The Problems of cultivated examination of stool - bacteriology

Abstract:

Průjmová onemocnění jsou celosvětovým problémem. V rozvojových zemích, kde je nízký hygienický standart a omezená dostupnost lékařské péče, je velká část mortality zapříčiněna právě průjmy, ve vyspělých zemích dochází k úmrtí méně často. V našich podmínkách mezi nejčastější infekce patří salmonelózy způsobené bakteriemi rodu Salmonella, kampylobakteriózy jejichž původci jsou bakterie rodu Campylobacter a dále enterotoxikózy, což jsou otravy z potravin. Gastroenteritidy mohou být způsobované také viry např. střední adenoviry, kaliciviry a astroviry. Parazitární gastroenteritidy jsou problémem výhradně rozvojových zemích v tropických oblastech.V teoretické části mé bakalářské práce jsem zpracoval obecnou charakteristiku průjmu a popis nejčastějších původců bakteriálních gastroenteritid a možnosti jejich diagnostiky. Praktickou část jsem zpracovával v laboratoři mikrobiologie Synlab v Českých Budějovicích, kde jsem prováděl identifikaci bakteriálních původců infekčních průjmů z výtěrů z rekta pomocí kultivace na vhodných mediích, přesné dourčení bylo provedeno pomocí biochemických testů, MALDI-TOF a aglutinačních testů k přesné sérotypizaci kmenů. Ze získaných dat a dat laboratoře jsem vypracoval statistiku porovnávající výsledky laboratoře s výsledky v celé České republice. Cílem mé práce bylo seznámit se s problematikou infekčních gastroenteritid, vypracovat odbornou rešerši na dané téma, popsat a osvojit si metody přímého průkazu bakterií, rutinně využívaných v mikrobiologické diagnostice průjmů - především kultivaci a statisticky srovnat výsledky laboratoře s celou Českou republikou.

Abstract:

Diarrheal diseases are a global problem. In developing countries, where there is a low hygienic standard and limited availability of medical care, a large proportion of mortality is caused by diarrhea, in developed countries deaths are less frequent. In our conditions the most common infections are salmonellosis caused by the bacteria of genus Salmonella, campylobacteriosis caused by Campylobacter bacteria, and Enterotoxicoses, which are food poisonings. Gastroenteritis can also be caused by viruses such as moderate adenoviruses, kaliciviruses and astroviruses. Parasitic gastroenteritis is a problem solely for developing countries in tropical areas. In the theoretical part of my bachelor thesis I elaborate the general characteristics of diarrhea and the description and possibilities of diagnostics of the most frequent agents of bacterial gastroenteritis. The practical part was processed in the laboratory of the microbiology Synlab in České Budějovice, where I carried out an identification of bacterial agents of infectious diarrhea from rectal swabs by cultivation on suitable media, accurate determination was performed by biochemical tests, MALDI-TOF and agglutination tests for accurate serotyping of strains. From the obtained data and data from the laboratory I elaborated a statistic comparing the laboratory results with the results in the whole Czech Republic. The aim of my thesis was to acquaint myself with the problematics of infectious gastroenteritis, to elaborate a specialized research on the topic, to describe and acquire methods of direct detection of bacteria routinely used in microbiological diagnosis of diarrhea - especially cultivation and statistically compare laboratory results with the whole Czech Republic.

Keywords

Průjmová onemocnění, rod Salmonella, rod Campylobacter, laboratorní diagnostika, četnost výskytu

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 3. 5. 2019

Thesis defence

• Supervisor: MVDr. Zuzana Lapáčková

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Health and Social Sciences

Bachelor programme / field:
Specialization in Health Service / Health Technician