Studium cytokininového receptoru AHK4 v modelové rostlině Arabidopsis thaliana.

Mgr. Viktor SEDLÁČEK

Bakalářská práce

Study of cytokinin receptor AHK4 from Arabidopsis thaliana.

Anotace:

Cytokininy jsou jednou z klíčových skupin rostlinných hormonů. Tyto hormony jsou v rostlinách rozpoznávány tvz. dvoukomponentovým systémem, jehož důležitou součástí je receptor - transmembránová histidinkinasa. V této práci jsme se zabývali cytokininovým receptorem CRE1/AHK4 z modelové rostliny Arabidopsis thaliana. Subcelulární lokalizace tohto receptoru dosud není zcela jasná. Původně byly objeveny dvě alternativní sestřihové varianty receptoru nazvané CRE1a a CRE1b, jejichž role dosud nebyla detailně prostudována. Kratší varianta CRE1a kóduje protein o velikosti 1057 aminokyselin, zatímco CRE1b obsahuje na svém amino konci o 23 aminokyselin více. V rámci tohto N-koncového peptidu se nachází hypotetický retenční motiv pro endoplazmatické retikulum, jehož přítomnost či nepřítomnost by mohla zásadně ovlivňovat subcelulární distribuci receptoru. Přemětem této práce bylo vytvoření binárních konstruktů pro transformaci rostlin Arabidopsis thaliana, které by bylo možné dále použít pro lokalizaci výše popsaných variant CRE1/AHK4 receptoru pomocí GFP a 4xC-Myc značky. V rámci této práce se podařilo naklonovat všechny klíčové komponenty nutné pro přípravu těchto binárních konstruktů. Tato práce by mohla přispět k lepšímu pochopení umístění cytokininového receptoru CRE1/AHK4 v rostlinných buňkách.

Abstract:

Cytokinins are important plant hormones. They are detected by a two-component system in planta. A key part of this system is a receptor, transmembrane Histidine kinase. In this work, we are interested in cytokinin receptor CRE1/AHK4 (Cytokinin Response 1/ Arabidopsis Histidine Kinase 4) from Arabidopsis thaliana. The subcellular localization of this receptor is still elusive. Originally there were identified two alternative splicing variants of CRE1 receptor named CRE1a and CRE1b. Since their discovery, these two variants were not studied in detail yet. The shorter variant CRE1a encodes for 1057 amino acids while CRE1b contains extra 23 amino acids at its amino terminus. This N-terminal peptide carries a hypothetical retention motif for Endoplasmic Reticulum, which could significantly affect the subcellular distribution of the receptor. The aim of this work is to prepare the binary constructs for Arabidopsis thaliana transformation, which could be further used to localize the cytokinin receptor CRE1/AHK4 by using GFP or 4xC-Myc tag. Within the framework of this thesis, all the key components necessary for preparing these constructs were cloned. This work could help us to understand the location of the cytokinin receptor CRE1/AHK4 better.

Klíčová slova

Cytokinin, CRE1, WOL, AHK4, cytokininový receptor, GFP, lokalizace

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 11. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 11. 6. 2018
• Vedoucí: Mgr. David Zalabák, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie