Využití mikrosatelitů v konzervační genetice ohrožených druhů vrb

Gabriela ČEPLOVÁ

Bachelor's thesis

Application of microsatellites in Conservation Genetics of endangered willow species

Abstract:

Bakalářská práce se zabývá rodem Salix z čeledi Salicaceae. Poukazuje na příčiny ohrožení u nás nejvíce ohrožených druhů vrb a jejich charakteristiky. Tyto druhy již byly v minulosti více či méně zkoumány na katedře botaniky Univerzity Palackého v Olomouci. Ve své práce jsem provedla rešerši předešlého výzkumu, u každého druhu shrnula provedené studie a zhodnotila studie nedokončené zasluhující si práci dokončit. V praktické části své práce jsem se zaměřila na otestování dřívější metodiky na populaci verby bylinné v Sudetech, s důrazem na geneticky nejvariabilnější populaci v Krkonoších (Studniční stěna). Celkem 53 vzorků druhu jsem testovala pomocí 13 mikrosatelitů. Přestože jednotlivé kroky experimentů (extrakce DNA, PCR) byly úspěšné, nepodařilo se mi získat hodnotitelné výsledky, fragmentační analýza nepřinesla hodnotitelné výsledky. Budoucí analýzy tak bude pravděpodobně vhodnější zaměřit na jinou metodu.

Abstract:

The bachelor thesis deals with the genus Salix of the family Salicaceae. It focuses on the most endangered autochthonous willow species and causes of their endangerment. These species have already been studied in the past at the Department of Botany of the Palacky University in Olomouc. In my work, I reviewed the previous willow research, summarized the studies performed for each species and commented the unfinished studies deserving to be completed. In the practical part of my work, I focused on testing the previous methodology for the population of Salix herbacea in the Sudetes (Bohemian Massif), with emphasis on the most genetically variable population in the Giant Mountains (Studniční stěna). I tested a total of 53 samples of the species using 13 microsatellites. Although the individual steps of the experiments (DNA extraction, PCR) were successful, I have not been able to obtain evaluable results, fragmentation analysis did not yield evaluable results. It would be more appropriate for future analyses to focus on another method.

Keywords

vrba bylinná, mikrosatelity, ohrožené druhy, Salix

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 31. 7. 2020

Thesis defence

• Supervisor: RNDr. Radim Jan Vašut, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Chemistry / Chemistry More Subjects Studium - Biology