Cross-species amplifikace mikrosatelitů z řádu trubkonosí u pelikána afrického (Pelecanus rufescens)

Kristýna KOPEČNÁ

Bakalářská práce

Cross-species amplification of microsatellites from Procellariiformes in Pink-backed Pelican (Pelecanus rufescens)

Anotace:

Hlavní náplní mé bakalářské práce bylo nalézt polymorfní mikrosatelitní lokusy u pelikána afrického. V teoretické části je řešena problematika zařazení pelikána afrického do systému a jeho vlastnosti. Dále obecná charakteristika mikrosatelitů, jejich mutace a využití. V experimentální části jsem použila metodu cross-species PCR amplifikace pro nalezení polymorfních mikrosatelitních lokusů u 6 nepříbuzných jedinců pelikána afrického. Celkem jsem testovala 213 párů primerů, které byly původně navrženy pro amplifikaci polymorfních mikrosatelitů u ptáků z řádu trubkonosí. Pro dosažení požadovaných výsledků byla dále provedena elektroforetická separace produktů v polyakrylamidovém gelu za denaturujících podmínek a jejich následná vizualizace. Po otestování všech lokusů bylo nalezeno celkem 24 polymorfních mikrosatelitů se 2 až 3 alelami na lokus.

Abstract:

The main goal of my bachelor thesis was to find polymorphic microsatellite loci of the Pink-backed pelican. The problematics of classification of the Pink-backed pelican into the system and its description are solved in the theoretical part. Then I wrote about the general characteristics of microsatellites, their mutations and utilisation. I have used the cross-species PCR amplification method for finding polymorphic microsatellite loci in 6 unrelated individuals of the Pink-backed pelican in the experimental part. Overall I have tested 213 pairs of primers which were originally designed for amplification of polymorphic microsatellites for the Procellariiformes species. Then I have done the electrophoretic separation of products in a polyacrylamide gel in denaturing conditions and following visualisation for the results scoring. After testing all loci I have found totally 24 polymorphic microsatellites with 23 alleles per locus.

Klíčová slova

PCR amplifikace, mikrosatelit, trubkonosí, pelikán africký, Pelecanus rufescens, Procellariiformes

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 6. 8. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie