Genetická analýza vybraných populací sýce rousného ( Aegolius funereus)

Bc. Dana Rymešová, Ph.D.

Master's thesis

Genetic analysis of selected population of Tengmalm's owl (Aegolius funereus)

Anotácia:

Práce přináší výsledky genetické analýzy párovacího systému sýce rousného (Aegolius funereus). V návaznosti na předchozí výzkum se v roce 2006 začalo s odběry krevních vzorků u rodičů a mláďat sýce rousného v Krušných horách a v r. 2007 i ve Žďárských vrších. Dosud bylo celkem genotypováno 107 jedinců z Krušných hor (19 samic, 15 samců a 73 mláďat) a 7 jedinců ze Žďárských vrchů (2 samice, 2 samci, 3 mláďata) na 7 mikrosatelitových lokusech. Při jednoduchém srovnání genotypů rodičů a mláďat bylo zjištěno, že u 41,7 % mláďat v krušnohorské populaci chybí alela jednoho ze sociálních rodičů. Tyto nesrovnalosti jsou však vysvětlitelné vysokou frekvencí nulových alel na některých lokusech (odhad frekvence nulových alel z programu Cervus 3.0 na základě genotypů všech adultů: až 0,404 na lokusu BOOW13; 0,025 na lokusu BOOW18). Do analýzy paternity v programu Cervus 3.0 vstupoval genotyp matky (tj. samice odchycené na hnízdě), jejích potomků a všech samců odchycených v dané oblasti. U 13,6 % mláďat byl přitom určen jako nejpravděpodobnější otec jiný samec, než který byl odchycen u hnízda (N = 66, tj. počet mláďat z hnízd, kde se podařilo získat i krevní vzorek sociálního otce). Hodnoty "LOD score" pro nejpravděpodobnějšího a sociálního otce se však lišily velmi málo a rovněž počet "mismatching" lokusů byl u obou samců stejný. Pouze 1,51 % mláďat (tj. 1 ze 66) lze skutečně považovat za výsledek mimopárové fertilizace (mimopárová mláďata v 6,25 % hnízd, N = 16). Genetická analýza populací je zatížena malým vzorkem adultních sýců ze Žďárských vrchů, avšak na základě dosavadních výsledků lze předpokládat, že obě zkoumané populace jsou v Hardy-Weinbergově rovnováze a nejsou geneticky diferencovány (Fis = 0,109; 95 % CI: -0,026 až 0,289; Fst = 0,015; 95 % CI: -0,022 až 0,049; Fit = 0,123; 95 % CI: -0,037 až 0,315).

Abstract:

This thesis deals with the genetic analysis of the mating system in the Tengmalm’s Owl (Aegolius funereus). In consequence of the previous research of the Tengmalm’s Owl blood samples of parents and young have been collected in the Krušné hory mountains since 2006 and in the Žďárské vrchy hills since 2007. In total, 107 individuals from the Krušné hory mountains (19 females, 15 males and 73 young) and seven individuals from the Žďárské vrchy hills (2 females, 2 males and 3 young) were genotyped on seven microsatellite loci. A missing allele of one parent was found by simply comparing genotypes of parents and offspring in 41.7 % of chicks from the Krušné hory mountains population. These discrepancies, however, can be explained by the high frequency of null alleles at some loci (the estimation of null alleles frequency in the program Cervus 3.0 based on genotypes of all adults: up to 0.404 at the locus BOOW13 and 0.025 at the locus BOOW18). The genotype of mother (i. e. the female trapped on the nest), all chicks and all adult males occurring in the population were input into the paternity analysis in the program Cervus 3.0. Another most-likely father than the male caught at the nest was determined in 13.6 % of young (N = 66, i. e. number of chicks in nests, where the social father was also trapped). However values of „LOD score“ for the most-likely father and the social father differed only slightly and both the males had equal number of mismatching loci. Only 1.51 % of young (i. e. 1 of 66) are really supposed to be the result of the extrapair fertilization (extra-pair chicks in 6.25 % of nests, N = 16). The genetic analysis of populations is affected by the small sample size of adult Tengmalm’s owls from the Žďárské vrchy hills, but it can be supposed that both investigated populations are in Hardy-Weinberg equilibrium and are not genetically differentiated (Fis = 0.109; 95 % CI: -0,026 to 0.289; Fst = 0.015; 95 % CI: -0.022 to 0.049; Fit = 0.123; 95 % CI: -0.037 to 0.315).

Kľúčové slová

Tengmalm’s Owl, sýc rousný, Aegolius funereus, paternita, paternity, EPC, EPY, EPP, mimopárové kopulace, extra-pair copulation, Žďárské vrchy, Krušné hory, mikrosatelity, microsatellites

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 19. 5. 2008

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 16. 6. 2008
• Vedúci: doc. RNDr. Zdeněk Řehák, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biology / Systematic Biology and Ecology