Proteinové markery metastatického potenciálu u karcinomu prsu a jejich exprese v závislosti na klinickopatologických charakteristikách

Bc. Dominika Váňová

Master's thesis

Protein markers of metastasis in breast carcinoma and their expression in the relationship with clinicopathological characteristics

Abstract:

Rakovina prsu je ve vyspělých zemích jedním z nejčastějších nádorových onemocnění žen a metastazování je hlavní příčinou úmrtí na toto onemocnění. V současné době využívané prognostické a prediktivní markery nejsou dostačující pro aplikaci co nejvhodnější možné léčby pro jednotlivé typy pacientek ani pro záchyt nemoci v premetastazujících stádiích. Hledání vhodnějších markerů je proto jedním z hlavních cílů soudobého výzkumu rakoviny prsu. V práci byla využita metoda 2-DE pro zmapování proteinového zastoupení rozsáhlého souboru vzorků od pacientek s odlišnými parametry histologického gradu, statusu lymfatických uzlin, estrogenních receptorů a receptorů HER2. Významné expresní změny mezi jednotlivými biologickými replikáty s protichůdnými klinickopatologickými charakteristikami poskytly celkem 17 proteinů, jejichž úloha v procesu vzniku, progrese a šíření rakoviny prsu byla zhodnocena porovnáním získaných výsledků s odbornou literaturou. Nejzajímavějšími z těchto proteinů byly desmin, potenciální marker myogenní diferenciace, AGR2 ovlivňující prognózu u ER pozitivních nádorů, proliferační marker PCNA a annexin A4 podporující migraci nádorových buněk. Jejich expresní profily byly srovnány s daty získanými v iTRAQ-2DLC-MS/MS experimentu provedeném mimo tuto diplomovou práci na stejném souboru pacientů.

Abstract:

Breast cancer is one of the most common women‘s cancer disease in developed countries and metastasis is the major cause of death of these patients. Currently used prognostic and predictive markers are not sufficient neither for the best suited cure application to individual patients nor a capture of premetastatic stages of the disease. That is why searching for more suitable markers is a preferred goal of current breast cancer research. In this thesis a 2-DE method was used for obtaining an overview of proteins contained in extensive set of breast cancer samples with different values of histological grade and lymph node, estrogen receptors and HER2 receptors’ status. 17 proteins significantly changed their expression between biological replicates with distinct clinicopathological characteristics. The review of biological role of these proteins was performed, namely in term of their effect on cancer formation, progression and dissemination. Among the most interesting proteins, desmin is a potential marker of myogenic differentiation, AGR2 influences prognosis of ER positive breast cancers, PCNA is a marker of proliferation and annexin A4 supports cancer cells migration. Expression levels of these proteins were compared with analogical data obtained in iTRAQ-2DLC-MS/MS experiment performed with the same set of samples.

Keywords

rakovina prsu, proteinové markery, metastázování, 2-DE

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 11. 5. 2011

Thesis defence

• Date of defence: 9. 6. 2011
• Supervisor: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Biochemistry / Biochemistry