Vztah mezi poruchami vývoje lidské dentice a genem pro EDA

Bc. Diana Jandová

Master's thesis

The relationship between developmental anomalies of the human dentition and EDA gene

Abstract:

Odontogeneze je poměrně složitý a dlouhodobý proces. Základem molekulárního řízení a kontroly procesu jsou reciproční interakce mezi epiteliální a mezenchymální tkání. Vše je dokonale geneticky naplánováno, včetně počtu, tvaru a uložení jednotlivých zubů. V dnešní době je známo přes 350 genů, které se podílí na vzniku a vývoji dentice u savců. Jedním z těchto genů je gen pro ectodysplasin A (EDA). Mutace v genu pro EDA jsou mimo jiné spojovány s defektním vývojem zubů a dentálními agenezemi. Cílem diplomové práce byla analýza exonových sekvencí genu pro EDA u vzorků DNA osob, u kterých byla stanovena diagnóza dentální ageneze. Ve čtvrtém exonu genu pro EDA byl identifikován homozygotní inzerčně-deleční polymorfismus v pozici g.70027876-70027918 s rizikovou deleční alelou D, který nezpůsobuje posun čtecího rámce. Ve stejném exonu se nacházela také potenciální homozygotní záměna A/T v pozici 581, která neovlivňuje kódování aminokyselin. Zbylé mutace byly nalezeny v nekódující 3’-UTR oblasti osmého exonu genu pro EDA. Nejčastějším případem byla detekce heterozygotního stavu nebo homozygotní záměny T/G v pozici 70038665. nukleotidu gDNA. Dále byla identifikována heterozygotní i homozygotní substituce cytosinu za thymin na nukleotidové pozici 70037013 gDNA, heterozygotní mutace g.70037030C>T a homozygotní záměna g.70037349G>A.

Abstract:

Odontogenesis is quite complex and long-term process. The basis of molecular management and control mechanisms of the process is reciprocal interactions between epithelial and mesenchymal tissues. Everything is perfectly genetically planned, including the number, shape and position of each individual tooth. Nowadays, it is known over 350 genes involved in the genesis and development of dentition in mammals. One of these genes is the gene for ectodysplasin A (EDA). Mutations in this gene are, besides other things, associated with a defective development of teeth and dental ageneses. The aim of the Master’s thesis was an analysis of exon’s sequences of the gene for EDA on DNA samples of persons that have been diagnosed with dental agenesis. In the fourth exon of EDA’s gene was identified homozygous insertion/deletion polymorphism in position g.70027876-70027918 with risk deletion allele D which doesn’t cause shifting of the reading frame. Potential homozygous substitution A/T in position 581 was found in the same exon and does not affect the coding of amino acids. The remaining mutations were found in the non-coding 3'-UTR region of the eighth exon of the EDA gene. The most frequent case was the detection of heterozygous or homozygous mutation T/G in nucleotide position 70038665 gDNA. Furthermore, heterozygous and homozygous substitution of cytosine to thymine in position 70037013 gDNA, heterozygous mutation g.70037030C>T and homozygous substitution g.70037349G>A were identified.

Keywords

Ectodysplasin A, EDA, odontogeneze, dentální ageneze, hypodoncie, oligodoncie, sekvenace, odontogenesis, dental agenesis, hypodontia, oligodontia, sequenation

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 9. 5. 2017

Thesis defence

• Date of defence: 7. 6. 2017
• Supervisor: prof. RNDr. Omar Šerý, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Biochemistry / Analytical Biochemistry