Klonování genu TGW6 (THOUSAND GRAIN WEIGHT 6) z Ječmene setého (Hordeum vulgare)

Kateřina SMOLKOVÁ

Bachelor's thesis

Cloning of the TGW6 (THOUSAND GRAIN WEIGHT 6) gene from barley (Hordeum vulgare).

Abstract:

Ječmen setý (Hordeum vulgare L.) je jednou z nejvýznamnějších polnohospodářských plodin. Zvyšování produkce takto významných plodin je důležitou úlohou v molekulárním šlechtitelství. Minulá zjištění naznačují, že by gen THOUSAND GRAIN WEIGHT 6 (TGW6) mohl mít přínosný vliv na zlepšení výnosových charakteristik u rýže případně i dalších plodin. Cílem experimentální části této práce bylo amplifikovat DNA fragment obsahující gen TGW6 a cca 3000 nukleotidů nacházejících se před tímto genem, kde by se měl nacházet nativní promotor tohoto genu, a vložit ho do vektoru obsahujícího gen pro GFP protein. Pomocí metody tzv. "seamless" klonování byl nakonec úspěšně připraven gen TGW6 s nativním promotorem fúzovaný s GFP jako reportérovou značkou. Tento konstrukt může být dále použitý pro klonování do vektoru pro transformaci ječmene, pomocí kterého by bylo možné lokalizovat expresi proteinu TGW6 a přispět tak k porozumění jeho úlohy při vývinu zrn ječmene.

Abstract:

Barley (Hordeum vulgare L.) is one of the most important agricultural crops. Increasing the production of such important crops is an important task in molecular breeding. Past findings suggest that the THOUSAND GRAIN WEIGHT 6 (TGW6) gene could have a beneficial effect on improving the yield characteristics in rice and possibly other crops. The aim of the experimental part of this work was to amplify a DNA fragment containing the TGW6 gene and approximately 3,000 nucleotides upstream of this gene, where the native promoter of this gene should be located, and insert it into the plasmid containing gene encoding GFP protein The TGW6 gene with a native promoter fused to GFP as a reporter tag was prepared using the method called seamless cloning. This construct can be further used for cloning into a barely transformation vector, which can allow us to localize TGW6 protein and contribute to the understanding of the role of the protein during the development of barley grains.

Keywords

Hordeum vulgare L., "seamless" klonování, TGW6 gen

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 5. 2022

Thesis defence

• Supervisor: Mgr. Mária Majeská Čudejková, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biotechnology and Genetic Engineering / Biotechnology and Genetic Engineering