Engine pro zobrazení 3D molekulárních dat

Mgr. Martin Peška

Bakalářská práce

WebGL Engine for 3D Molecule Visualization

Anotace:

Současná řešení vizualizace molekulárních dat v prostředí prohlížeče ve většině případů vyžadují dodatečné doinstalování modulů pro spuštění programu. Cílem této práce bylo navrhnout a implementovat engine pro zobrazování 3D molekulárních dat bez dodatečného doinstalování modulů pro spuštění programu. Návrhová část práce se zabývá analýzou vstupních dat a požadavků na výslednou aplikaci. Součástí práce je přehled vizualizačních metod a současného software pro vizualizaci molekul. Implementace obsahuje několik vybraných metod pro vizualizaci molekul, z nichž některé jsou zaměřené na vizualizaci velkých proteinových molekulárních struktur. Závěrečná část práce se věnuje testování snímkové frekvence a času zpracování operací. U navrženého řešení je kladen důraz na interaktivitu a u zobrazovacích metod na kvalitu zobrazení.

Abstract:

Current solutions visualization of molecular data within the web browser in most cases require additional installation of modules to run the program. The aim of this thesis was to design and implement an engine for rendering 3D molecular data without additional installation of modules to run the program. Analytical part of the thesis analyzes input data and the requirements on the final application. Survey of the current visualization methods and software is part of the thesis. The implementation contains several selected methods for molecular visualization, some of them are aimed at visualizing large protein structures. The final part is devoted to testing the frame rate and the processing time of operations. In the proposed solution is an emphasis on interactivity and for visualization methods on visual quality.

Klíčová slova

vizualizace molekul, vizualizace proteinů, sekundární struktura, struktura proteinu, atom, chemická vazba, analýza JSON objektu

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 3. 1. 2014

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 4. 2. 2014
• Vedoucí: RNDr. David Sehnal, Ph.D.
• Oponent: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

Bakalářský studijní program / obor:
Informatika / Počítačová grafika a zpracování obrazu