Komparativní genomika hlavního histokompatibilního komplexu MHC

Mgr. Martin Plášil, Ph.D.

Doctoral thesis

Comparative genomics of the major histocompatibility complex MHC

Anotácia:

Tato práce je zaměřena na hlavní histokompatibilitní komplex (MHC) u velbloudů. Oblast MHC u velbloudů má standartní genomickou organizaci: MHC třídy II - MHC třídy III - MHC třídy I. Organizace jednotlivých genů je také podobná ostatním druhům. Většina vybraných genů MHC se vyznačuje velmi nízkou variabilitou, což je v rozporu s obecnou představou MHC jako jedné z nejpolymorfnějších oblastí genomu. Evoluční vztahy na základě sekvencí MHC jsou velmi komplexní a obecně nesledují evoluční historii daných druhů.

Abstract:

This thesis is focused on the major histocompatibility complex (MHC) in Old World camels. The MHC region follows the general layout of MHC class II - MHC class III - MHC class I. The organization of individual MHC genes in camels is similar to other species. Most of the selected genes display very low variability, contrary to the general idea of the MHC being one of the most polymorphic genomic regions. The evolutionary relationships based upon MHC sequences are very complex and in general do not follow evolutionary history of these species.

Kľúčové slová

hlavní histokompatibilitní komplex, MHC, variabilita, SNP, velbloud, major histocompatibility complex, variability, camel

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 17. 10. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 26. 10. 2018
• Vedúci: prof. MVDr. RNDr. Petr Hořín, CSc.
• Oponent: Mgr. Dagmar Čížková, Ph.D., MVDr. Ján Matiašovic, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Doctoral programme / odbor:
Biology (4-years) / General and Molecular Genetics