Naskočení do virového rozjetého vlaku: Studie diverzity a evoluce RNA virů trypanosomatid, se zaměřením na viry leishmanií

Mgr. Diego Henrique FAGUNDES MACEDO

Doctoral thesis

Jumping in the viral bandwagon: A study on the diversity and evolution of RNA viruses in trypanosomatids with the emphasis on leishmaniaviruses

Abstract:

Trypanosomatids are flagellated parasites that include important pathogens of human such as Trypanosoma and Leishmania spp. However, a major part of trypanosomatid diversity is represented by insect-restricted species, which are called monoxenous (one host), as opposed to the dixenous Leishmania, Trypanosoma and Phytomonas (two hosts). For a long time Leishmania spp. were known to be infected with a double-stranded RNA (dsRNA) Leishmania RNA virus 1 and 2 (LRV1/2) belonging to the family Totiviridae. It was demonstrated that LRV1 has a considerable impact on Leishmania pathogenicity in humans. Since then, viruses have become one of the hot topics in trypanosomatid research. At the same time, monoxenous trypanosomatids were reported to possess viruses of several taxonomical groups, including leishbunyaviruses, narnaviruses, tombus-like viruses and others. This thesis includes studies demonstrating that Leptomonas pyrrhocoris and other monoxenous trypanosomatids such as Blechomonas spp. carry phylogenetically distinct types of viruses that may or may not be related to previously described LRV1/2, a work documenting a non-LRV virus in Leishmania (Mundinia) martiniquensis (LBV- LmarLBV1) and another project investigating the new isolate of LRV2 in Leishmania major from Uzbekistan. Lastly, by performing a thorough phylogenetic analyses we provided putative evolutionary scenarios explaining the observed diversity of viruses in this group of protists.

Abstract:

Trypanozomy jsou bičíkatí parazité, kteří zahrnují důležité patogeny člověka jako je Trypanosoma a Leishmania spp. Nicméně hlavní část rozmanitosti trypanozom představují druhy omezené na hmyz, které se nazývají monoxenní (jeden hostitel), na rozdíl od dixenních druhů Leishmania, Trypanosoma a Phytomonas (dva hostitelé). Po dlouhou dobu bylo známo, že jsou Leishmania spp. infikovány dvouvláknovými RNA (dsRNA) viry Leishmania RNA virus 1 a 2 (LRV1/2) patřící do čeledi Totiviridae. Bylo prokázáno, že LRV1 má značný vliv na patogenicitu leishmanie u lidí. Od té doby se viry staly jedním z nejžhavějších témat ve výzkumu trypanozom. Ve stejné době byly hlášeny viry monoxenních trypanozom z několika taxonomických skupin, včetně leishbunyavirů, narnavirů, tombus-like virů a dalších. Tato práce zahrnuje studie prokazující, že Leptomonas pyrrhocoris a jiné monoxenní trypanozomy jako Blechomonas spp. nesou fylogeneticky odlišné typy virů, které mohou nebo nemusí souviset s dříve popsanými LRV1/2; práce, dokumentující non-LRV virus v Leishmania (Mundinia) martiniquensis (LBVLmarLBV1); a další projekt zkoumající nový izolát LRV2 v Leishmania major z Uzbekistánu. A konečně, provedením důkladné fylogenetické analýzy jsme poskytli domnělé evoluční scénáře vysvětlující pozorovanou rozmanitost virů v této skupině protistů.

Keywords

Trypanosomatidae, Crithidia, Leptomonas, Phytomonas, Obscuromonas, Blastocrithidia, dvouvláknová RNA, virus, Narnaviridae, Bunyavirales, Tombus-like virus podobný, Ostravirus, Leishmaniavirus

Language used: English

Date on which the thesis was submitted / produced: 5. 11. 2021

Accessible from:: 31. 12. 2999

Thesis defence

• Date of defence: 9. 12. 2021
• Supervisor: prof. Vyacheslav Yurchenko, Ph.D., prof. Vyacheslav Yurchenko, Ph.D.

University of Ostrava

Faculty of Science

Doctoral programme / field:
Biology / Biology