Automatická analýza kanálů transmembránových proteinů – Bc. Zdenko Olšovský
Bc. Zdenko Olšovský
Bachelor's thesis
Automatická analýza kanálů transmembránových proteinů
Automatic analysis of transmembrane protein channels
Abstract:
Cílem této bakalářské práce bylo navrhnout a implementovat softwarový nástroj pro automatickou analýzu transmembránových proteinů – Pore Finder. Ten je schopen automatické analýzy transmembránových proteinů s využitím databází OPM a PDB. Pro jeho implementaci bylo využito WebChemistry API vyvíjené na pracovišti školitele. Pore Finder automaticky detekuje póry v transmembránových proteinech, a určuje …moreAbstract:
The aim of this bachelor thesis was to develop a software tool for automatic analysis of transmembrane proteins. The developed program, Pore Finder, is capable of automatic analysis of transmembrane proteins with utilization of OPM and PDB databases where the core of the program is based on the WebChemistry API. Subsequently is able to provide computed pores with physicochemical characteristics which …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 18. 5. 2015
Identifier:
https://is.muni.cz/th/vop2p/
Thesis defence
- Date of defence: 19. 6. 2015
- Supervisor: RNDr. Lukáš Pravda
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceBachelor programme / field:
Biochemistry / Chemoinformatics and Bioinformatics
Theses on a related topic
-
Analýza tunelů a pórů v proteinech
Eliška Špačková -
Vizualizace biomakromolekul
David Sehnal