Vývoj nových mikrosatelitových markerů pro Salvia pratensis (Lamiaceae).

Bc. Adéla Špínová

Bakalářská práce

Development of novel microsatellite markers for Salvia pratensis (Lamiaceae)

Anotace:

Práce je věnovaná vývoji nových mikrosatelitových markerů pro Salvia pratensis coby modelový druh středoevropských suchých trávníků a testování jejich variability u zástupců 4 populací. Markery byly vyvíjeny za účelem využití v dalším výzkumu zaměřeném na fylogeografii společenstev suchých trávníků a jejich postglaciální migraci. Experimentální část práce spočívala v izolaci DNA celkem 80 zástupců 4 populací S. pratensis, testování 52 kandidátních mikrosatelitových lokusů pomocí PCR a fragmentační analýzy a stanovení základních populačně genetických charakteristik u 5 vyvinutých markerů. Získané mikrosatelitové markery vykazovaly značnou variabilitu a budou dále využitelné v populačně genetických studiích S. pratensis.

Abstract:

This bachelor thesis deals with the development of novel microsatellite markers for Salvia pratensis, a species representing the vegetation of Central European dry grassland, and testing their variability in samples from 4 populations. The markers were developed for the purpose of further research in the field of dry grassland community phylogeography and post-glacial migration. The experimental part of the work consisted of DNA extraction from 80 individuals obtained from 4 populations of S. pratensis, testing 52 candidate loci using PCR and fragmentation analysis and assessing basic population genetic parameters from 5 developed markers. The novel microsatellite markers displayed substantial variability and will be suitable for use in population genetic research on S. pratensis.

Klíčová slova

mikrosatelity, populační genetika, post-glaciální migrace, Salvia pratensis

Keywords

population genetics, microsatellites, post-glacial migration, Salvia pratensis

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 25. 4. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Karol Krak, Ph.D.

Česká zemědělská univerzita v Praze

Fakulta životního prostředí

Bakalářský studijní program / obor:
Environmentální vědy / Aplikovaná ekologie