Detekce mutací v genu pro LDL receptor

Bc. Karin KOCIÁNOVÁ

Master's thesis

Detection of Mutations in the Low Density Lipoprotein Receptor Gene

Abstract:

Familiární hypercholesterolemie (FH) je dědičně podmíněné metabolické onemocnění vyznačující se autozomálně dominantním typem dědičnosti. Jeho podstatou jsou mutace v genu pro LDL receptor (LDLR). Cílem diplomové práce bylo provést, u vybrané skupiny 25 pacientů, vyšetření nejčastějších mutací, resp. exonů často postihovaných mutacemi, genu pro LDL receptor. Pozitivní nález by u těchto pacientů mohl pomoci objasnit jejich stanovenou diagnózu (infarkt myokardu, mozku, resp. anginy pectoris). Přímou detekcí byly vyšetřeny mutace D245E (exon 5), R395W a 1272ins96 (exon 9) a G571E (exon 12). U žádného z námi vyšetřovaných pacientů nebyla nalezena mutace. Dále byly na přítomnost mutací v genu pro LDL receptor vyšetřeny exony 4, 6, 9, 12 a 14. U žádného z námi vyšetřovaným pacientů nebyla ani po sekvenaci vybraných vzorků po SSCP analýze nalezena mutace. V rámci vyšetření exonu 12 byly identifikovány dva již dříve popsané polymorfismy 1725C>T a 1773T>C.

Abstract:

Familial hypercholestrolemia (FH) is a hereditary metabolic disease with autosomal dominant type of inheritance. It is caused by mutations in the LDL receptor gene (LDLR). The aim of the thesis was to perform analyses of the most common mutations and the often mutated exons of the LDLR gene in a group of 25 patients with myocardial infarction, angina pectoris, or brain arterial infarction. Positive findings could help to explain their diagnosis. The D245E (exon 5), R395W, 1272ins96 (exon 9) and G571E (exon 12) mutations were tested by a mutation specific analysis. There was no mutation found in the patients. Additionaly, exons 4, 6, 9, 12 and 14 of the LDL receptor were screened for mutations using SSCP and positive findings were verified by direct sequencing. None of the patients was a carrier of any mutations. In the tested exon 12, there were previously described two polymorfisms 1725C>T and 1773T>C identified.

Keywords

hypercholesterolemie, LDL receptor, SSCP.

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 12. 5. 2008

Accessible from:: 12. 5. 2008

Thesis defence

• Date of defence: 16. 6. 2008
• Supervisor: Ing. Ivana Ježíšková

University of Ostrava

Faculty of Medicine

Master programme / field:
Public Health Care / Laboratory Examination Methods in Public Health Protection