Integrovaný metabolismus lidské střevní mikrobioty a hostitele

Bc. Hana Seličová

Bachelor's thesis

Integrated metabolism of the human gut microbiota and the host

Abstract:

Střevní mikrobiotu lze řadit k faktorům vnějšího prostředí, které zásadním způsobem ovlivňují lidské zdraví. Molekulární interakce specifických mikrobiálních metabolitů s metabolickými a signálními dráhami hostitele a jeho fyziologické funkce byly zatím zkoumány jen okrajově. Metabolity lidské střevní mikrobioty interagují s xenobiotickými receptory typu PXR nebo AHR a působí imunomodulačně na vrozený imunitní systém hostitele. Hlavním cílem této bakalářské práce bylo optimalizovat metody ke stanovování koncentrací mikrobiálních metabolitů v biologickém materiálu (tj. sérum, moč) od zdravých dobrovolníků a určit korelace konkrétních metabolitů mezi biologickými matricemi. K analýze mikrobiálních metabolitů byly využity moderní techniky ultra-účinné kapalinové chromatografie (UHPLC) a hmotnostní spektrometrie (MS).

Abstract:

Gut microbiota is an important environmental factor affecting human health. However, the molecular mechanisms of interaction of microbial metabolites with metabolic and signalling pathways of the human host are marginally understood. Essential physiological functions are associated with metabolites of human gut microbiota, particularly immunomodulation of the innate immune system of the host via interaction with PXR or AHR xenobiotic receptors. The main aim of this bachelor thesis was development and optimization of methods for quantification of microbial metabolites in a biological sample (i.e., serum, urine) from healthy volunteers to assess the correlation of individual metabolites across biological matrices. Microbial metabolites were analysed using modern techniques of ultra-high performance liquid chromatography (UHPLC) and mass spectrometry (MS).

Keywords

lidská střevní mikrobiota, mikrobiom, imunomodulace, metabolismus tryptofanu, ultra-účinná kapalinová chromatografie, hmotnostní spektrometrie, kvantitativní profilování metabolitů, human gut microbiota, microbiome, immunomodulation, tryptophan metabolism, ultra-high performance liquid chromatography, mass spectrometry, quantitative metabolic profiling

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 17. 6. 2020

Thesis defence

• Date of defence: 15. 7. 2020
• Supervisor: PharmDr. Zdeněk Spáčil, Ph.D.
• Reader: prof. MUDr. Vojtěch Thon, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Biochemistry / Biochemistry