Segmentation of Dense Cell Populations using Convolutional Neural Networks – Bc. Filip Lux
Bc. Filip Lux
Diplomová práce
Segmentation of Dense Cell Populations using Convolutional Neural Networks
Segmentation of Dense Cell Populations using Convolutional Neural Networks
Anotace:
Diplomová práce se zabývá schopnostmi konvolučních neurálních sítí segmentovat mikroskopové snímky hustých buněčných populací. Pro výzkum byl zvolen datová množina obrazů ze soutěže Cell Tracking Challenge, který není snadné řešit tradičními technikami zpracování obrazu. Vytvořili jsme a natrénovali vlastní konvoluční neurání síť segmentující tyto snímky, která je úspěšná i v mezinárodním srovnání …víceAbstract:
This thesis examines the ability of convolutional neural networks to segment microscopy images of dense cell populations. We chose an image dataset from the Cell Tracking Challenge competition, which is not easy to solve using traditional image processing techniques. We built and trained our convolutional neural network able to segment these images, which is successful also in the international context …více
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 5. 2018
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/v35vy/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 18. 6. 2018
- Vedoucí: doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D.
- Oponent: prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D.
Citační záznam
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasarykova univerzita
Fakulta informatikyMagisterský studijní program / obor:
Informatika / Umělá inteligence a zpracování přirozeného jazyka
Práce na příbuzné téma
-
Visualization of hidden layers in convolutional neural networks
Jakub Hruška -
Modelling small-RNA binding using Convolutional Neural Networks
Eva Klimentová -
Automatic Recognition of User Interface States Using Convolutional Neural Networks
Klára Petrovičová -
Interpretation techniques for deep neural networks in digital histopathology
Martin Krebs -
Automatic trackingand assessment of chronic wounds using augmented skin imaging and convolutional neural networks
Monika Molnárová -
Segmentation of Cell Nuclei in Fluorescence Microscopy Image Data of Organoids
Hynek Pavlacký -
Segmentation of Cell Nuclei in Large-Scale Multichannel Image Data of Organoids
Jan Juračka -
Cell segmentation from wide-field light microscopy images using CNNs
Ali GHAZNAVI