Strukturní a funkční studie stafylokokového fága phi812

Bc. Barbora Břenková

Master's thesis

Structural and functional studies of staphylococcal phage phi812

Anotácia:

Bakteriofág φ812 je polyvalentní stafylokokový fág s potenciálem pro využití ve fágové terapii. Tato diplomová práce se věnuje studiu dvou konektorových proteinů, gp98 a gp99 bakteriofága φ812. Struktury obou proteinů byly vyřešeny metodou kryo-elektronové mikroskopie. Protein gp99 funguje jako „zátka“ regulující uvolnění genomu, jakmile se fág bazální destičkou naváže na receptor na povrchu hostitelské buňky. Gp98 zprostředkovává vazbu mezi gp99 a portálovým proteinem a zároveň řeší nesoulad symetrií mezi těmito dvěma proteiny. CRISPR/Cas9 systém byl použit v buňkách S. aureus v pokusech o editaci fágového genomu.

Abstract:

Bacteriophage φ812 is a polyvalent staphylococcal phage with a potential to be used in phage therapy. This thesis focuses on structural studies of two proteins from the connector of phage φ812, gp98 and gp99. Structures of both of the proteins were determined using cryo-electron microscopy. Gp99 functions as a stopper that regulates genome release upon host receptor recognition by the phage baseplate. Gp98 connects gp99 to the portal protein and resolves symmetry mismatch between these two complexes. CRISPR/Cas9 system in S. aureus cells was employed for trials of genome editing of φ812.

Keywords

S. aureus, Spounavirinae, φ812, Rentgenová krystalografie, Kryo-elektronová mikroskopie, Konektor, Tape measure protein, CRISPR/Cas9, X-ray crystallography, Cryo-electron microscopy, Connector

Jazyk práce: English

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 10. 5. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 6. 6. 2019
• Vedúci: Mgr. Pavel Plevka, Ph.D.
• Oponent: Ing. Jan Dohnálek, Ph.D

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Experimental Biology / Molecular Biology and Genetics