Hlodavci jako rezervoár hantavirů

Bc. Jan KAMIŠ

Master's thesis

Abstract:

Tato studie sledovala přítomnost hantavirů u volně žijících hlodavců a hmyzožravců z urbánních lokalit České republiky. Velké množství rezervoárových hostitelů hantavirů bylo vyšetřeno na přítomnost hantavirové RNA v různých tkáních a orgánech, za použití univerzálních a specifických primerů pro amplifikaci fragmentů velkého a malého segmentu hantavirové genomové RNA. Získané nukleotidové sekvence byly použity k rekonstrukci fylogenetických vztahů. Byly detekovány čtyři různé druhy hantavirů, včetně dvou (potenciálně) patogenních pro člověka. Dále byl byly pozorovány mezidruhové hostitelské spillover infekce a tkáňový tropismus specifický pro jednotlivé druhy hantavirů.

Abstract:

This study reveals the presence of hantaviruses in free-living rodents and insectivores in urban areas in the Czech Republic. A large number of hantavirus reservoir hosts were tested for hantavirus RNA in different tissues, using universal and specific primers for amplification of the large and medium fragments of hantavirus genomic RNA. Phylogenetic relationships of obtained nucleotide sequences of hantaviruses were reconstructed. Four different species of hantaviruses were detected, including two species pathogenic (or potentially pathogenic) for humans, suggesting a threat for public health. Additionally, inter-family spillover infections and hantavirus species-associated tissue tropism were recorded in rodent hosts.

Keywords

Dobrava orthohantavirus, Tula orthohantavirus, Seewis orthohantavirus, Asikkala orthohantavirus, hlodavci, fylogenetika, hostitelská specificita, tkáňová specifita

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 13. 4. 2022

Thesis defence

• Supervisor: MVDr. Jana Kvičerová, Ph.D.

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Parasitology