Chromatin Visualization in Jupyter Notebook and VR – Bc. Martin Beľa
Bc. Martin Beľa
Master's thesis
Chromatin Visualization in Jupyter Notebook and VR
Chromatin Visualization in Jupyter Notebook and VR
Anotácia:
Cieľom mojej práce je vizualizácia chromatínu, ktorá zobrazuje polohy segmentov chromatínu predpovedaných zo vzdialeností medzi segmentmi generovanými metódou Hi-C. Táto vizualizácia je integrovaná do notebooku Jupyter, čo umožňuje súčasnú vizualizáciu, predspracovanie údajov a analýzu v rámci jednej platformy. Okrem toho bolo vytvorené VR zobrazenie, ktoré je plynule spojené s vizualizáciou v Jupyter …viacAbstract:
The aim of my thesis was to develop a chromatin visualization that displays the positions of chromatin segments predicted from distances between segments generated by the Hi-C method. The visualization is integrated into Jupyter Notebook, which allows for simultaneous visualization, data preprocessing, and analysis within the same platform. Additionally, a VR view was developed. It is seamlessly connected …viac
Jazyk práce: English
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 5. 2024
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/xktg1/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 17. 6. 2024
- Vedúci: RNDr. Jan Byška, Ph.D.
- Oponent: RNDr. Filip Opálený
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / odbor:
Visual informatics / Computer graphics and visualisation
Práce na příbuzné téma
-
Virtual Environments in the Context of Biochemical Visualization
David Kuťák -
Library for Boolean function manipulation in Rust and Python
Ondřej Hrdlička -
Webové rozhraní s využitím programovacího jazyka Python
Petr Raida -
RESTful API a klientská knihovna v jazyce Python pro server APhoS
Pavel Kinc -
Implementation of a python library for provenance
Roland Olejník -
Python a jeho využití v matematice
Tomáš Salavec -
Python-FLASK for creating simple web applications
Nina Rybárová