Bc. Martin Beľa

Master's thesis

Chromatin Visualization in Jupyter Notebook and VR

Chromatin Visualization in Jupyter Notebook and VR
Anotácia:
Cieľom mojej práce je vizualizácia chromatínu, ktorá zobrazuje polohy segmentov chromatínu predpovedaných zo vzdialeností medzi segmentmi generovanými metódou Hi-C. Táto vizualizácia je integrovaná do notebooku Jupyter, čo umožňuje súčasnú vizualizáciu, predspracovanie údajov a analýzu v rámci jednej platformy. Okrem toho bolo vytvorené VR zobrazenie, ktoré je plynule spojené s vizualizáciou v Jupyter …viac
Abstract:
The aim of my thesis was to develop a chromatin visualization that displays the positions of chromatin segments predicted from distances between segments generated by the Hi-C method. The visualization is integrated into Jupyter Notebook, which allows for simultaneous visualization, data preprocessing, and analysis within the same platform. Additionally, a VR view was developed. It is seamlessly connected …viac
 
 
Jazyk práce: English
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 5. 2024

Obhajoba závěrečné práce

  • Obhajoba proběhla 17. 6. 2024
  • Vedúci: RNDr. Jan Byška, Ph.D.
  • Oponent: RNDr. Filip Opálený

Citační záznam

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky

Masaryk University

Faculty of Informatics

Master programme / odbor:
Visual informatics / Computer graphics and visualisation