Chromatin Visualization in Jupyter Notebook and VR – Bc. Martin Beľa
Bc. Martin Beľa
Diplomová práce
Chromatin Visualization in Jupyter Notebook and VR
Chromatin Visualization in Jupyter Notebook and VR
Anotace:
Cieľom mojej práce je vizualizácia chromatínu, ktorá zobrazuje polohy segmentov chromatínu predpovedaných zo vzdialeností medzi segmentmi generovanými metódou Hi-C. Táto vizualizácia je integrovaná do notebooku Jupyter, čo umožňuje súčasnú vizualizáciu, predspracovanie údajov a analýzu v rámci jednej platformy. Okrem toho bolo vytvorené VR zobrazenie, ktoré je plynule spojené s vizualizáciou v Jupyter …víceAbstract:
The aim of my thesis was to develop a chromatin visualization that displays the positions of chromatin segments predicted from distances between segments generated by the Hi-C method. The visualization is integrated into Jupyter Notebook, which allows for simultaneous visualization, data preprocessing, and analysis within the same platform. Additionally, a VR view was developed. It is seamlessly connected …více
Jazyk práce: angličtina
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 5. 2024
Identifikátor:
https://is.muni.cz/th/xktg1/
Obhajoba závěrečné práce
- Obhajoba proběhla 17. 6. 2024
- Vedoucí: RNDr. Jan Byška, Ph.D.
- Oponent: RNDr. Filip Opálený
Plný text práce
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasarykova univerzita
Fakulta informatikyMagisterský studijní program / obor:
Vizuální informatika / Počítačová grafika a vizualizace
Práce na příbuzné téma
-
Virtual Environments in the Context of Biochemical Visualization
David Kuťák -
Library for Boolean function manipulation in Rust and Python
Ondřej Hrdlička -
Webové rozhraní s využitím programovacího jazyka Python
Petr Raida -
RESTful API a klientská knihovna v jazyce Python pro server APhoS
Pavel Kinc -
Implementation of a python library for provenance
Roland Olejník -
Python a jeho využití v matematice
Tomáš Salavec -
AIML 2.1 Chatbot Design Language Interpreter in Python
Michal Barnišin