G-kvadruplexy v genomech virů: funkce a potenciální terapeutické aplikace

Bc. Jana Koutná

Bakalářská práce

G-quaruplexes in viral genomes: function and potential threrapeutic applications

Anotace:

G-kvadruplexy jsou nekanonické sekundární struktury nukleových kyselin, které se tvoří v oblastech DNA a RNA bohatých na guanin. Kromě genomů prokaryot a eukaryot byly tyto struktury objeveny i v genomech virů, kde se podílí na regulaci klíčových procesů životního cyklu virů. Navázání specifických ligandů na G-kvadruplexy může vést k inhibici replikačního cyklu virů. Tato práce charakterizuje G-kvadruplexy, které se vyskytují v genomech medicínsky významných virů, dále se zabývá ligandy, které specificky interagují s těmito G-kvadruplexy a popisuje vliv těchto interakcí na životní cyklus virů, včetně jejich možného využití v terapii virových infekcí.

Abstract:

G-quadruplexes are non-canonical nucleic acids secondary structures that form within guanine-rich regions of DNA and RNA. Besides prokaryotic and eukaryotic genomes, those structures have been described in viral genomes, where they can take part in regulation of key viral processes. Binding of specific ligands to G-quadruplex structures can lead to inhibition of viral replication cycle. This thesis characterizes G-quadruplexes in genomes of medically significant viruses, follows up ligands, that specifically interact with those G-kvadruplexes and desbribes consequences of those interactins for viral life cycle, including their potential utilization in antiviral therapy.

Klíčová slova

G-kvadruplex, virus, antivirová terapie, ligandy, virový genom, DNA, RNA, G-quadruplex, antiviral therapy, ligands, viral genome

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 15. 6. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 8. 7. 2020
• Vedoucí: Mgr. Luděk Eyer, Ph.D.
• Oponent: Mgr. Daniel Renčiuk, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Experimentální biologie / Molekulární biologie a genetika