Molecular and phenotypic analysis of annexin knock-out mutants of Arabidopsis thaliana

Emma GENTRIC

Bakalářská práce

Abstract:

Tato bakalářská práce je zaměřena na annexiny, proteinovou rodinu přítomnou v širokém spektru eukaryotických organismů, od lidí až po rostliny. Molekuly annexinu se mohou vázat na různé molekuly, včetně fosfolipidů, aktinu a hlavně iontů vápníku. Vazebné vlastnosti annexinů významně ovlivňují jejich intracelulární role. Účastní se nesčetných buněčných procesů, jako je vesikulární transport nebo transport iontů. Kromě toho také hrají roli ve vápníkové signalizaci, která reguluje stresové reakce rostlin. U Arabidopsis thaliana je annexinová rodina složená z 8 genů a proteinů. Cílem této práce bylo konkrétně prozkoumat molekulární a fenotypové důsledky vyřazení genu annexinu 3, ANNAT3, u Arabidopsis thaliana. Studie využívala genotypování jako nástroj pro výběr homozygotních mutantů. Poté následovala fenotypová analýza mutantních ověřených rostlin se zvláštním zaměřením na kořeny. Získané výsledky naznačují, že ANNAT3 se ukazuje jako pozitivní regulátor délky kořenových vlásků, přičemž vykazuje negativní vliv na velikost listů.

Abstract:

This bachelor thesis focuses on annexins, a protein family present in a wide range of eukaryotic organisms, spanning from humans to plants. Annexin molecules can bind to various molecules, including phospholipids, actin and most importantly, calcium ions. The binding properties of annexins have significant implications for their intracellular roles. They are involved in a myriad of cellular processes, such as membrane trafficking or ion transport. Furthermore, they also play a role in calcium signalling, which regulates plant stress responses. In Arabidopsis thaliana, the annexin gene and protein family consist of 8 members. This study aimed to specifically investigate the molecular and phenotypic consequences of knocking out annexin 3, ANNAT3, gene in Arabidopsis thaliana. The study employed genotyping as a tool to select homozygous mutants. This was followed by a phenotypic analysis of the mutant plants, with a particular focus on roots. The results obtained suggest that ANNAT3 emerges as a positive regulator of root hair length while exhibiting a negative influence on leaf size.

Keywords

Arabidopsis thaliana, annexiny, genotypování, kořenové vlásky, listové růžice, křížení

Jazyk práce: angličtina

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 6. 5. 2024

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Olga Šamajová, Dr.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biotechnologie a genové inženýrství / Biotechnologie a genové inženýrství