Modifikace tRNA v Arabidopsis a jejich napojení na cytokininovou biosyntézu

Bc. Dominika Honusová

Bachelor's thesis

tRNA modifications in Arabidopsis and their connection with cytokinin biosynthesis

Anotácia:

Tato bakalářská práce je zaměřena na modifikace nukleových kyselin, a to především na modifikace nacházející se na adenosinu v pozici 37 u tRNA a jejich souvislost s biosyntézou cytokininů. V teoretické části jsou shrnuty známé informace o této problematice. Experimentální část je založena na fylogenetické analýze enzymů, jež jsou zodpovědné za syntézu modifikace cyklického N6-threonylkarbamoyladenosinu (ct6A). Dále na genotypování linií obsahující mutace v genech pro tyto enzymy u Arabidopsis thaliana a na kvantifikaci změn kontinuity tracheálních elementů protoxylému v semenáčcích mutantních rostlin.

Abstract:

This thesis deals with the modification of nucleic acids, especially with those present on tRNA located on the adenosine in position 37 and their connection with cytokinin biosynthesis. Published information about this topic is summarized in the theoretical part. Experimental part focuses on phylogenetic analysis of enzymes, which are required for the synthesis of cyclic N6-threonylcarbamoyladenosine (ct6A) modification. Second section focuses on genotyping the lines with insertion mutations in the genes encoding these enzymes in Arabidopsis thaliana and to examining their protoxylem phenotypes.

Kľúčové slová

cis-zeatin, ct6A, cytokininy, cZ, fylogenetická analýza, KEOPS komplex, kontinuita elementů protoxylému, N6-threonylkarbamoyladenosin, Sua5, t6A, tRNA modifikace, Tcd1 cis-zeatin, cytokinins, phylogenetic analysis, KEOPS complex, N6-threonylcarbamoyladenosine, protoxylem elements continuity, tRNA modifications, Tcd1

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 4. 5. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2017
• Vedúci: Mgr. Kamil Růžička, Dr. rer. nat.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry